Sıtma ve neosporoz OTU deübikitinazların 3B modellenmesi ve tedavi için Yeni OTU inhibitörlerinin tespit edilmesi

SITMA VE NEOSPOROZ OTU DEÜBİKİTİNAZLARIN 3B MODELLENMESİ VE TEDAVİ İÇİN YENİ OTU İNHİBİTÖRLERİNİN TESPİT EDİLMESİ Sıtma, Plazmodyum parazitlerinin neden olduğu potansiyel olarak ölümcül bulaşıcı bir hastalıktır. Parazitler dişi Anofel sivrisinekler yoluyla bulaşır. Dünya nüfusunun yaklaşık yarısı sıtma hastalığı riski altındadır. Parazitler, mevcut tüm ilaç tedavilerine karşı direnç kazanmıştır, bu nedenle etkili tedaviye ihtiyaç vardır. CCHFV gibi zorunlu hücre içi parazitler olan virüslerin hayatta kalması, NF-κB sinyal yollarını antagonize ettikten sonra konakçı hücrenin istila edilmesine bağlıdır. Kırım Kongo Kanamalı Ateşi Virüsü (KKKAV), hücre içi invazyonu, geniş dekonjugasyon aktivitesine sahip olan viral OTU proteazı kullanarak gerçekleştirir. Bu viral OTU proteininin inhibisyonu, Y89-W99 paketi ile ilişkilidir. İlginç bir şekilde, sıtma ve Neospora parazitlerinde, CCHFV'deki OTU alanına karşılık gelen korunmuş amino asitler bulundu. Sıtma ve Neospora parazitlerinin, OTU proteinlerinin dekonjugasyon özelliğini kullanıp NF-κB yolunu antagonize ederek aktivitelerini gerçekleştirebileceği ileri sürüldü. Bu projede, OTU proteinlerinin sıtmada önemli bir hedef olabileceğini hipotezini öne sürüldü ve bu OTU proteinlerini sıtmada aday ilaçlar olarak hedefleyen inhibitörleri keşfetmeyi amaçlandı. Proje hem in siliko, hem in vitro hem de in vivo çalışmalar içermektedir. Burada ilk kez, üç farklı sıtma parazit suşunun ve Neospora parazitinin yeni OTU deubikuitinazları 1) üç boyutlu olarak modellenmiş, 2) rekombinant olarak üretilmiş, 3) karakterize edilmiş ve DUB aktiviteleri in vitro ve in vivo deneylerle kanıtlanmıştır. Bunlara ek olarak, yeni OTU proteinlerinin hem doğal bağışıklık yolaklarını hem de hücre mono-Ub ve polyUb seviyelerini nasıl manipüle ettiği gösterilmiştir. Yaklaşık 5.000.000 bileşik içeren bir kütüphane hazırlandı ve bu moleküller OTU DUB'lara karşı hedeflendi. Moleküler kenetlenme skorlarına, ilaç olabilirliklerine, ADME-toksisite özelliklerine, IC50 değerlerine, mikro seviyelerdeki konsantrasyonlarında bile DUB inhibe edici özelliklerine, molekül tedavilerinin hem RNA hem de protein düzeyindeki ekspresyona etkilerine göre dört molekül keşfedildi. Sonuç olarak, bugüne kadar ticari bir aşısı, spesifik ilacı veya onaylı tedavisi olmayan sıtma hastalığına karşı en iyi aday ilaç molekülleri bulunmuştur.