Validation of prognostic biomarkers for overall survival in melanoma patients undergoing autologous vaccination

Malign Melanoma, nadir görülen en ölümcül deri kanseri türüdür. Malign melanoma hastalarının tanı ve tedavisi için belirteçlerin eksikliği, hastaların erken teşhisi ve hastalar için uygun destekleyici tedavi yöntemlerinin seçilmesinin önünde önemli bir engeldir. Melanomanın erken teşhis edilmesi takdirde IA ve IB evresindeki hastaların 5-10 yıllık hayatta kalma oranları Amerika Kanser Topluğunun istatistiklerine gore %85'in üzerindedir. Bunun yanı sıra, ilerleyen evre ve düşen hayatta kalma oranları ile birlikte, cerrahi müdahele sonrası uygun destekleyici tedavinin seçiminin hastaların hayatta kalma oranlarına ve hayat kalitelerin artırılmasına etkisi yüksektir. Melanomanın kanser türleri arasında en immunojenik kanser türü olması sebebiyle, malign melanoma hastalarını hedef alan immunoterapi denemeleri son 20 yılda daha geniş kapsamlı olarak geliştirilmektedir. Bunlara dayanarak, klinisyenlerin cerrahi müdahele sonrası otolog aşı yapılması için uygun malign melanom hastalarını belirlemelerinde kullanabilecekleri prognoz ile ilişkili belirteç araştırmaya karar verdik. İş birliği içinde olduğumuz araştırma grubunun katkısıyla, 28 malign melanom hastası primer hücre kültürü ve Luminex platformunda gen ekspresyon profilerini temin ettik. Güdümsüz Sağkalım Analiz Programı (USAT: laboratuarımızda geliştirilmiş sağ kalımla ilişkili genleri tespite yarayan bir yazılım) sonuçları temelinde, prognozla ilişkisi muhtemel genlerin gen ifade profilerini primer hücre kültürlerinde, qRT-PCR ile onamaya karar verdik. Hücre kültürü sırasında değişen ve dolaysıyla gen ifadeleri Luminex verileriyle örtüşmeyecek hale gelmiş hücre kulturlerinin Mutlak Sıra Farkı Toplamı (SARD) analizine dayanarak elenmesinden sonra, 21 örnekte çalıştığımız 10 genin doğrulanabilen 8'i; CT genleri (SSX1, MAGEA1), epitelyal mezenkimal belirteç genleri (CDX2, CLDN1), DNA onarım genleri (ERCC1, LIG3), transforme edici büyüme fakötürü (TGFα), kinaz A taşıyıcı proteini (AKAP13) idi. Laboratuarlarımızdaki CT genlerinin kanserlerdeki yüksek immunojenik potensiyellerine ait geçmiş çalışmalar, SSX1 ve MAGEA1 genlerini otolog aşılanmış malign melanoma hastalarında esas ilgimiz haline getirdi. Sonuçlarımız CT gen ifadesi yüksek olan malign melanom hastalarına otolog aşı yapılmasının genel sağkalımı artırmada faydalı olduğunu düşündürtüyor. Buna ek olarak, yüksek TGFα ifadesinin de otolog aşılamaya tabi tutulacak hastalarda prognozla ilişkili belirteç olduğu anlaşılmaktadır.