Preklinik ORYX-MRS: sıçan beyninde proton manyetik rezonans spektroskopi verilerinin analiz yazılımı

Manyetik rezonans spektroskopi (MRS), beyin metabolizmasını araştırmak için güçlü bir yöntemdir; ancak mevcut yazılımlar esas olarak insan çalışmaları için tasarlanmıştır ve preklinik uygulamalar için sınırlı destek sunar. Bu tez, küçük hayvan modellerinden elde edilen tek voksel 1H-MRS verilerinin işlenmesi için geliştirilmiş, MR Solutions (Guildford, UK) formatlarına uygun Preclinical ORYX-MRS adlı MATLAB tabanlı grafiksel arayüzlü yazılımı tanıtmaktadır. Yazılım; ham veri yükleme, maske oluşturma, atlas tabanlı kayıt, segmentasyon, spektral kalite değerlendirmesi ve bölgesel metabolit kantifikasyonunu bütünleşik bir akışta sunar. Performansı farklı sıçan beyni veri setleriyle değerlendirilmiştir. Sonuçlar; doğru voksel lokalizasyonu, atlas kaydı sırasında mekânsal bütünlüğün korunması, gri madde, beyaz madde ve BOS'un otomatik segmentasyonu ile hem ham .mrd dosyalarının hem de LCModel çıktılarının (.coord, .table) işlenmesini göstermektedir. Bölgesel analizler, aracın anatomik bağlama oturtulmuş metabolit profilleri sunabilme yeteneğini daha da ortaya koymuştur. Preclinical ORYX-MRS, mevcut yazılımların çoğunlukla klinik MRS'e yönelik olmasının aksine, preklinik MRS için veri işleme ve analiz desteği sağlar. Ancak, küçük bir veri setinde doğrulanmış olması, yalnızca tek voksel MRS verileriyle sınırlı kalması ve şu anda yalnızca MR Solutions veri formatını desteklemesi gibi bazı sınırlamaları vardır. Çok voksel MRS görüntüleme (MRSI) veri analizi, çoklu üretici desteği ve uzunlamasına istatistiksel analiz, aracın gelecekteki potansiyel geliştirmeleri arasındadır. Sonuç olarak, Preclinical ORYX-MRS; klinik çalışmalar için tasarlanmış araçlar ile preklinik araştırmaların özel gereksinimleri arasındaki boşluğu dolduran, kullanıcı dostu, sağlayıcıya özgü ve verimli bir platform sunmaktadır.