Biyolojik ağların interaktif görselleştirilmesi için crossbar web servisinin implementasyonu
2020
0 views
0 downloads
Advisor: Prof. Dr. Mehmet Volkan Atalay
Abstract (EN)
Existing computational tools, resources, and services to assist experimental biomedical research lack data diversity and data connectivity and therefore, they are limited in helping to solve real world problems. Within the framework of CROssBAR project aiming for drug discovery, CROssBAR database (CROssBAR-DB) integrated diverse biomedical resources with the predictions of a comprehensive computing resource developed using machine learning and deep learning-based methods. It is crucial for the users to perform easily search on CROssBAR-DB, and then to visualize the result of the search. For this reason, CrossBAR web service (CROssBAR-WS) is designed, developed and implemented within the scope of this thesis. In CROssBAR-WS, knowledge graphs can be generated by using the open-source graph library Cytoscape.js. CROssBAR-WS is available at crossbar.kansil.org.
Author
Dr. Ahmet Atakan
Institution
How to Cite
Ahmet Atakan (Master Thesis). Biyolojik ağların interaktif görselleştirilmesi için crossbar web servisinin implementasyonu, 2020, Middle East Technical University.
Keywords
License
Tüm Hakları Saklıdır
This work is shared under the specified license terms.
More theses from Middle East Technical University
- Türk savunma sanayii için bir Ar-Ge yol haritası(2020)
- Sürü robotların müşterek hareketinde beklenti(2021)
- Çatışmalı bir süreçte devlet olma mücadelesi; Kıbrıs Türk toplumunun siyasal iktisadi analizi(2021)
- Spiro-pirolopiridazinlerin sentezi(2021)
- Çift kuyu modeli kullanılarak jeotermal kuyuda NCG enjeksiyonunun jeokimyasal modellemesi(2021)
- (SNX3)'ün EGFR-pozitif meme hücrelerinde erken ve uzun dönem EGF uyarımına duyarlılığı(2021)
