Implementation of crossbar web service for interactive visualizations of biological networks

Deneysel biyomedikal araştırmalara yardımcı olmak için mevcut işlemsel araçlar ve hizmetlerin, veri çeşitliliği ve veri bağlantılılığı açılarından eksiklikleri bulunduğundan dolayı, gerçek problemlere çözüm üretme noktasında sınırlı kalmaktadır. Çeşitli biyomedikal kaynaklarla birlikte yapay ve derin öğrenmeye dayalı yöntemlerle geliştirilen kapsamlı bir hesaplama kaynağına dayalı tahminler, ilaç keşfi problemi için oluşturulan CROssBAR projesi kapsamındaki CROssBAR veritabanına (CROssBAR-VT) entegre edilmiştir. Kullanılar açısından CROssBAR-VT'de kolayca arama yapmak ve ardından arama sonuçlarının görsellenmesi büyük önem arz etmektedir. Bundan dolayı CROssBAR ağ servisinin tasarımı, geliştirilmesi ve gerçekleştirilmesi bu tez kapsamında yapılmıştır. CROssBAR ağ servisinde oluşturulan bilgi grafları, açık kaynak kodlu çizge kütüphanesi olan Cytoscape.js kullanırak üretilmiştir. CROssBAR ağ servisine crossbar.kansil.org bağlantısı üzerinden ulaşılabilir.