Bazı endemik Colchicum l. taksonlarının kloroplast genom dizilerinin belirlenmesi

Colchicum bitkisi içerdiği alkaloidler nedeniyle farmasotik açıdan, araştırma çalışmalarında kullanılan laboratuvar reaktif sarfları açısından ticari değere sahip bir bitkidir ve birçok taksonu ülkemizde yaygındır. Bu çalışmada, Türkiye'ye endemik olan Colchicum taksonlarından Colchicum baytopiorum, Colchicum davisii ve Colchicum lingulatum subsp. rigescens taksonlarından elde edilen total genomu yeni nesil dizileme yöntemiyle dizilenmiş ve genomik DNA'dan kloroplast DNA'sı ayıklanmıştır. Elde edilen veriler ile kloroplast DNA'sının bitki markörleri olan bazı genler üzerinden kloroplast DNA'ları arasındaki farklar ve benzerlikleri ortaya çıkarmak, filogenetik çalışmalara ışık tutmak, yeni markörlerin ortaya çıkması için bir adım atmak hedeflenmiştir. Bu çalışmada, toplanan 3 farklı Colchicum taksonunun yaprak numunelerinden genomik DNA izolasyonu yapılmış ve Illumina HiSeq2000 yeni nesil dizileme (NGS) cihazında örnek materyallerin DNA tüm dizisi çıkarılmış ve CLC Genomics programı ile bu verilerin biyoinformatik analizi yapılmış ve yorumlanmıştır.