Use of an intronic polyadenylation site in breast cancers

Alternatif poliadenilasyon 3'UTR uzunluğunu ve/veya sekansını etkileyen önemli bir mRNA işleme mekanizmasıdır. 3'UTR'deki bu değişimler mRNA stabilitesi, lokasyonu ve translasyonel verimliliği üzerinde önemli ölçüde etkilidir. Alternatif poliadenilasyon tiplerinden biri olan intronik poliadenilasyon (İPA), 3'UTR yerine intronik poli(A) bölgelerinde gerçekleşmektedir. Son bulgular, insan genlerinin yaklaşık 20%'sinin en az bir intronda poli(A) bölgesinin bulunduğunu, hatta bazı intronların birden çok poli(A) bölgesi içerdiğini göstermiştir. İntronik poliadenilasyonun üzerine yoğunlaşılmasının başlıca nedeni, farklı İPA izoformlarının oluşmasının hem protein ekspresyonunu hem de fonksiyonunu etkileyebilecek potansiyelinin olmasıdır. Bu araştırmada, östrojen reseptör pozitif (ER+) meme kanseri hücrelerinde, in vitro ve in siliko yöntemlerle EIF2B3 geninin intronik poli(A) bölgesinin östrojene bağlı kullanımı üzerine çalışılmıştır. Söz konusu intronik izoformun ekspresyonu MCF7 ER+ meme kanseri hücresinde, diğer meme kanseri hücrelerinde ve hasta örneklerinde gösterilmiştir. Ayrıca, bu intronik poli(A) bölgesinin kullanımı 3'RACE, klonlama ve sekanslama çalışmaları ile de desteklenmiş olup, EIF2B3 intronik izoformun bir protein ifadesinin olduğu da ortaya çıkarılmıştır. Sonuç olarak bu çalışmada, EIF2B3 geninin intronik poli(A) bölgesinin meme kanseri hücrelerinde kullanıldığı in siliko olarak öngörülmüş ve bunu doğrulayan in vitro bulgular da sunulmuştur. İleride yapılması planlanan deneyler de, söz konusu genin intronik poli(A) bölgesi seçiliminin hücredeki sonuçlarını gösterecek ve kanser hücrelerindeki buna benzer intronik poliadenilasyon olaylarının kavranmasına ışık tutacaktır.