An interaction matrix of BTB domain-containing transcription factors

BTB protein bölgesi, ökaryotlarda bulunan bir proten-protein etkileşim birimidir. Geniş bir etkileşim alanına sahip, ayırt edici bir üç boyutlu yapıdadır. Dıştaki amino asitleri çok çeşitlilik göstermekle birlikte; dimerizasyon, oligomerleşme ve NCOR SMRT gibi eşbaskılayıcılarla etkileşim işlevlerine sahip olabilir. BTB sahibi transkripsiyon faktörleri çok çeşitlidir ve bağışıklık sistemi gelişiminden hücre döngüsü kontrolüne kadar bir çok süreçte rol alırlar. Bu işlevleri tam olarak anlamak için, söz konusu proteinlerin etkileşim ağlarının gösterilmesi gerekmektedir. Bu çalışmada, çeşitli BTB bölgesi içeren transkripsiyon faktörleri ve onların etkileşim ağlarını, in vivo ve in vitro ortamlarda yüzey plazmon rezonansı (SPR) ve flörosan ikili-hibriti (F2H) yöntemlerini içeren, özel ve sistematik deneyler geliştirmek amaçlanmıştır. Bu doğrultuda BTB protein bölgelerinin kendi içlerinde ve diğer farklı BTB bölgeleriyle gerçekleştirdikleri dimerizasyon matrisini oluşturduk.