Master'sOpen Access

Boosting large-scale graph embedding with multi-level graph coarsening

2020
0 views
0 downloads
Advisor: Dr. Öğr. Üyesi Kamer Kaya

Abstract (TR)

Çizgeler protein etkileşim ağlarından sosyal ağlara hemen her yerde bulunmaktadır. Fakat çizgelerin düzensiz veri yapısı, çizgelerin üzerinde bağlantı tahmini, düğüm sınıflama ve aykırılık belirleme gibi makine öğrenmesi görevleri çalıştırmak adına bir engel teşkil etmektedir. Çizge gömme, çizgeleri çok boyutlu bir uzayda tanımlayarak, çizgeler üzerinde makine öğrenmesi görevlerinin kolayca çalıştırılabilmesini sağlamaktadır. Literatürde bir dizi çalışma bu metodun faydalarını göstermiş olsa da, çizge gömme yoğun işlem teşkil eden bir metottur. Güncel gömme uygulamaları, ya büyük ölçekli çizgeleri işleyememekte ya da işlemek için pahalı bir donanım gerektirmektedir. Bu çalışmada orijinal, paralel ve çok katmanlı bir çizge indirgeme metodu ileri sürmekteyiz. Bu metot çizge gömmenin performansını hem zaman hem de doğruluk açısından geliştirmektedir. Bu çalışmada, bahsedilen metot, GOSH adlı büyük ölçekli çizgeleri tek bir ekran kartı ile işleyebilen bir çizge gömme uygulamasına entegre edilmiştir. Çizge indirgeme metodu entegre edildiğinde, GOSH ortalama olarak 14 kat daha hızlı çalışmakta ve orta büyüklükteki çizgelerin çoğunda daha başarılı AUCROC değerleri elde etmektedir. Veri setindeki, 66 milyon düğüm ve 1.8 milyar bağlantı bulunan en büyük çizgeyi, GOSH, %93.4 AUCROC elde ederken işlemi bir saatin altında tamamlamıştır. Bunlara ek olarak bu çalışmada, çizge indirgeme kalitesinin çizge gömme kalitesine etkisini incelemekteyiz. Deneylerimiz indirgeme sürecinin dengeli olması gerektiğini ve ileri sürülen indirgeme metodunun çizge gömme açısından üstün bir performans sergilediğini göstermektedir.

Author

Dr. Taha Atahan Akyıldız

How to Cite

Taha Atahan Akyıldız (Yüksek Lisans Tezi). Boosting large-scale graph embedding with multi-level graph coarsening, 2020, Sabanci University.

Keywords

License

Tüm Hakları Saklıdır

This work is shared under the specified license terms.

More theses from Sabanci University