Melanoma hücre hatlarında IRF4 bağımlılığının karakterizasyonu

İnterferon düzenleyici faktör 4 (IRF4, aynı zamanda MUM1, LSIRF, NFEM5 ve ICSAT olarak da bilinir) B-hücrelerinin olgunlaşmasında ve farklılaşmasında önemli etkileri olan bir transkripsiyon faktörüdür. IRF4'un ilk olarak 'lenfositlere özgü IRF ailesi üyesi' ismiyle tanımlamasına karşın, melanositlerde de IRF4 anlatımı olduğu sonraki çalışmalarda gösterilmiştir. Yakın zamanda IRF4'un melanosit pigmentasyonunda rol aldığı tanımlanana kadar melanositlerdeki fonksiyonu bilinmemekteydi. Lenfositlerdeki önemli fonksiyonel işlevlerinin yanı sıra, IRF4 anlatımı birçok lenfoid kanseri ile ilişkili bulunmuştur. Örneğin, multipl mylelom (MM) ve aktifleşmiş B-hücre benzeri difuz büyük B-hücreli lenfoma (ABC-DLBCL) kanseri hücreleri yüksek miktarda IRF4 anlatımına sahiptir ve IRF4'a bağımlılıkları vardır, bu da eğer IRF4 susturulursa bu hücrelerin öleceği anlamına gelir. Şaşırtıcı şekilde, immünohistokimyasal çalışmalar ile melanoma örneklerinde lenfoid-olmayan kanser türlerine kıyasla dikkat çekici miktarda IRF4 seviyesine rastlanmıştır. Ek olarak, bazı genom ölçeğinde ilişkilendirme çalışmaları (GWAS) da IRF4 polimorfizmlerini melanoma ile ilişkilendirmiştir. Bu çalışmalar ışığında IRF4'un melanoma hücre hatlarındaki fonksiyonunu belirlemek için yola çıktık. İlk olarak halka açık gen anlatımı veritabanlarını kullanarak, lenfoid-olmayan kanserlere kıyasla, melanomalarda yüksek miktarda IRF4 anlatımı olduğunu doğruladık. Ayrıca in vitro deneyler ile; denediğimiz birçok melanoma hücre hattında dikkat çekici miktarda endojen IRF4 anlatımı olduğunu, diğer lenfoid-olmayan kanser hücre hatlarında da belirlenebilir seviyede bir anlatımı olmadığını teyit ettik. Daha sonra melanoma hücrelerinde, lentiviral enfeksiyon ve RNA interferaz sistemi kullanarak IRF4'u susturduk, ve hücrelerin rekabete dayanan sağlık durumlarında düşüş gözlemledik. Sonuçlarımız melanoma hücrelerinin, tıpkı MM ve ABC-DLBCL hücrelerinde gözlemlendiği gibi, IRF4'a karşı in vitro bağımlılığının olduğunu gösteriyor.