Correction of artifacts in formalin-fixed paraffin-embedded tissue section images with contrastive unpaired image-to-image translation

Formalin-fiksasyon ve parafine gömme (FFPE), 19. yüzyılın sonlarından beri histoloji ve patolojide kullanılan bir örnek hazırlama ve koruma tekniğidir. FFPE numunelerinin hazırlanması karmaşık, uzun ve standardize edilmesi zor bir süreç olduğundan ve dokunun karmaşık histolojik ve sitolojik özelliklerinden dolayı FFPE slaytları genellikle kusurlar içerir. Kusurlar doku sabitleme, işleme, gömme, mikrotomi, boyama ve kapatma sırasında ortaya çıkar. Bu kusurlar, görüntülerde artefakt olarak adlandırılır; boyama tutarsızlıklarını, doku kıvrımlarını, gevezeliği, kalem izlerini, bulanıklığı, hava kabarcıklarını ve kontaminasyonu kapsayan bir terimdir; ek olarak diğer kusurlar. Dijital patoloji için FFPE slaytlarındaki yapaylıkları düzelten, eşleştirilmemiş bir görüntüden görüntüye çeviri yaklaşımı olan FFPE++ öneriyoruz. Yöntemimiz, uzamsal dikkat bloğu ve kendi kendini düzenleme kaybı ile karşılaştırmalı öğrenmeyi kullanan ve hem dokusal detayların görünürlüğü hem de hücresel özellikler açısından daha yüksek kaliteye yol açan derin öğrenmeye dayalı bir yaklaşımdır. Kurul onaylı 10 patolog, FFPE++ yöntemimiz ile yumurtalık, tiroid ve akciğerin standart FFPE bölümleri arasında karşılaştırmalı testler gerçekleştirerek, yaklaşımımızın histopatolojik tanı için görsel olarak tutarlı görüntülerle sonuçlandığını gösterdi.