Expression analysis of transcription factors Elk-1 and Pea3

Transkripsiyon faktörleri, DNA dizilerinin promotör ya da artırıcı bölgelerine bağlanarak gen anlatımını düzenleyen proteinlerdir. Bu düzenlemeyi tek başlarına ya da diğer proteinlerle kompleks oluşturarak gen anlatımını artırır ya da baskılarlar. Bu proteinler hücre büyümesinde, çoğalmasında ve apoptozda anahtar rol oynarlar. Elk-1, ETS ailesine üye olan bir transkripsiyon faktörü olup MAPK yolağı tarafından aktive edilen ve nöronal sağ kalım ve farklılaşmayı sağlayan c-fos gibi genleri düzenler. Pea3 transkripsiyon faktörü ise ETS domain ailesinin üyelerinden biri olan ve diğer üyeler gibi hücre çoğalması, farklılaşması, gelişmesi ve ölümünü içeren sinyal transdüksiyon yolağının nükleer hedefi olarak görev yapar. Düzenleyici olayların birçoğu ETS domain proteinlerinin MAPK yolağındaki fosforlanma olaylarını kapsar. Bu çalışmada, Elk-1 ve Pea3 transkripsiyon faktörlerinin fonksiyon ve gen anlatımlarını farklı yönlerden analiz etmeye çalıştık. Çalışmanın ilk aşamasında, farklı hücre hatlarında Elk-1 transkripsiyon faktörünün açık okuma penceresinde alternatif kırpılma formlarını tanımlamayı amaçlamış olup, ikinci kısmında ise, ileriki fosforilasyon analizlerinde kullanılmak üzere doğal ve mutant GST-Pea3 füzyon proteinlerinin anlatımlarını optimize ettik.