Master'sOpen Access

Characterization of FAM134B in the context of hepatocellular carcinoma and endoplasmic reticulum stress

2011
0 views
0 downloads
Advisor: Prof. Dr. Mehmet Öztürk

Abstract (TR)

FAM134B (Family with sequence similarity 134, member B)'nin daha önceki çalışmalarımızda Huh7 karaciğer kanseri hücre hattında kendiliğinden gelişen hücre yaşlanmasında yapılan gen ifade profilleri analizi sonucunda hücre yaşlanmasıyla ilgili olduğunu tespit ettik. Bu bilgiden yola çıkarak bu çalışmada özellikle FAM134B'nin karaciğer kanseri ve endoplazmik retikulum stresi konuları çerçevesinde niteliklerinin belirlenmesini amaçladık. İlk olarak, hücre yaşlanması ve FAM134B ilişkisi Huh7 hücrelerinde erken hücre yaşlanmasına neden olarak test ettik. Adriamisin ve TGF-ß kullanılarak sebep olunan erken hücre yaşlanması FAM134B gen ifadesinde artışa neden olmadı. Bu nedenle, kendiliğinden gelişen hücre yaşlanmasında görülen gen ifade artışının doğrudan hücre yağlanma fenotipiyle alakalı olmadı sonucuna vardık. Daha sonra, FAM134B'nin iyi diferansiye ve kötü diferansiye karaciğer kanseri hücre hatlarındaki mRNA ve protein seviyelerini analiz ettik. Sonuçlara göre, FAM134B ifadesi karaciğer kanserinin daha ileri aşamasını ve metastatik karakteristiğini temsil eden kötü diferansiye hücre hatlarında daha yüksektir. Diğer taraftan, FAM134B ve endoplazmik retikulum stres ilişkisi üzerinde yaptığımız araştırmalar, FAM134B'nin tapsigargin, tunikamisin ve DTT gibi endoplazmik retikulum stresine neden olan kimyasallarla gen ifadesinde artışla yanıt verdiğini tespit ettik. Bu nedenle, FAM134B'nin endoplazmik retikulum stresine yanıt veren bir gen olduğunu gösterdik. Bu sonuçla birlikte, kötü diferansiye hücre hatlarındaki yüksek FAM134B protein ve mRNA miktarlarını bu hücrelerdeki bazal seviyede endoplazmik retikulum stres yanıtıyla ilişkilendirdik. Ayrıca, bu geni yüksek seviyede ifade eden Huh7 hücrelerinde yaptığımız deneyler sonucunda FAM134B'nin kendi başına endoplazmik retikulum stres yanıtı ve otofajiye neden olamayacağını gösterdik. Ancak, tapsigargin ve tunikamisin kullanarak yapılan yapay endoplazmik retikulum stresi durumunda FAM134B'nin hücre yanıtında etkili olduğunu gördük. Huh7 hücrelerinde FAM134B geninin yüksek ifadesi tapsigargin ve tunikamisinin neden olduğu kontrollü hücre ölümü yanıtına duyarlılığı artırdığı sonucuna vardık. Ayrıca bu genin yüksek ifadesinin yine aynı şekilde endoplazmik retikulum stresi uygulandığı durumda hücrelerin çoğalma yeteneğini daha çok azalttığını gösterdik. Buna bağlı olarak, FAM134B, dışarıdan endoplazmik retikulum stresinin başlatıldığı durumlarda stresin şiddetinin artmasında rol oynadığını düşünmekteyiz. Bununla birlikte, dokular üzerinde yaptığımız çalışmada FAM134B ifadesinin beyin ve karaciğerde yoğun olduğunu gösterdik. Tüm bunlar göz önüne alındığında, FAM134B'nin karaciğer dokusunda biriken hasara ve böylece karaciğer kanserinin gelişimine etkili olma ihtimali vardır.

Author

Dr. Mustafa Yılmaz

How to Cite

Mustafa Yılmaz (Yüksek Lisans Tezi). Characterization of FAM134B in the context of hepatocellular carcinoma and endoplasmic reticulum stress, 2011, Bilkent University.

Keywords

License

Tüm Hakları Saklıdır

This work is shared under the specified license terms.

More theses from Bilkent University