GABRG2 geninde bulunan bir kırpılma bölge mutasyonunun fonksiyonel analizi ve gabaa reseptörüne etkisi

Epilepsi, nüfusun yüzde ikiden fazlasını etkileyen, kontrol edilemeyen nöron deşarjları şeklinde ortaya çıkan bir hastalıktır ve bazı formları genetik belirleyiciler içermektedir. Kalıtsal epilepsilerin ana grubu genetik jeneralize epilepsi (GJE) dir ve çocukluk çağı epilepsisi (ÇÇE), GJE'nin yaygın olan bir alt grubudur. Gama-aminobütirik asit (GABA), memeli beynindeki temel inhibitör nörotransmitterdir. Bu reseptör GABAA ve GABAB olmak üzere iki reseptör sınıfıyla görev yapar. GABAerjik iletimin genetik mutasyonlarla bozulması epileptik nöbetlere sebep olmaktadır. Beşinci kromozomun uzun kolunun 34. bölgesinde bulunan GABAA reseptör gama 2, GABRG geni tarafından kodlanır. GABRG2 geninin kodlayıcı kısmında bulunan mutasyonların yanı sıra, bu genin intronik kısmında da mutasyonlar gözlenmektedir. T-G transversiyonunun (IVS6+2T-G) GABRG2'da 6. intronun kırpılma donör bölgesini değiştirdiği, kriptik kırpılma bölgesini aktive ettiği ve parsiyel intron eklenmesi yarattığı bilinmektedir. Bu çalışmanın amacı CAE hastasında tespit edilen GABRG2 geni kırpılma varyantının GABAA reseptörüne etkisinin incelenmesidir. In silico kırpılma bölgesi araçları bu mutasyonun kriptik kırpılma bölgesi yaratabileceğini göstermiştir. Yer yönlendirmeli mutagenez ile GABRG2 geninde bilinen mutasyon yaratılmış ve hastadaki varyantla beraber klonlanarak mini genler yaratılmıştır. Transfeksiyon sonrası ekspresyonlar RT-PCR ile incelenmiştir. İlgili mutasyonun kırpılmaya etkisi benzer deneysel koşullarda daha önce gösterilmemiş olup ÇÇE hastasındaki GABRG2 varyantının sessiz bir varyant olduğu ve kırpılma işlemini değiştirmediği gösterilmiştir.