NLRP13'ün kesiliminin ve makrofaj polarizasyonundaki muhtemel görevinin araştırılması

NOD benzeri reseptörler (NLR'ler) temel olarak inflamatuar yanıtlardaki rolleri ve mikrobiyal patojenlere karşı konak savunmasındaki rolleri ile bilinirler, ancak aynı zamanda metabolik bozukluklar, otofaji regülasyonu, transkripsiyon regülasyonu, erken embriyogenez, üreme ve benzeri roller ile de ilişkilidirler. NLRP13, PYRIN bölgesi bulunduran bir NLR proteinidir ve kemirgen olmayanlarda bulunur. Literatürde NLRP13 hakkında neredeyse hiç bilgi bulunmamaktadır. NLRP13'ün iltihaplanma oluşumunda rol oynadığı ve bu proteinin kesilmiş formlarının hücrede bulunabileceği laboratuvarımızın eski öğrencileri tarafından belirlendi. Bu proje boyunca, bölünmesi ve makrofaj polarizasyonuna olası katılımı araştırıldı. NLRP13 proteininin C-terminalinin, immünofloresan ve konfokal mikroskopi ile aşırı ifade modelinde Caspase-8 tarafından parçalandıktan sonra mitokondride bulunduğunu gösterdik. NLRP13'ün hücre içi endozomal trafiğe katılmadığı belirtildi. Ek olarak, NLRP13'ün makrofaj polarizasyonuna dahil olabileceğinden şüpheleniliyordu. Bunun için THP-1 monositleri M1 ve M2 makrofajlarına farklılaştırıldı, daha sonra RT- qPCR ve akış sitometrisi ile analiz edildi. Yabanıl tip, plazmit kontrolü ve NLRP13'ün aşırı ifade eden THP-1 makrofajları için hiçbir fark gözlenmedi. Genel olarak, NLRP13'ün kesilmiş formlarının lokalizasyonu in vitro olarak belirlendi ve NLRP13'ün THP1'de makrofaj polarizasyonunda hiçbir rolü olmadığı gösterildi.