Tohum uyuşukluğu döngüsü mekanizmalarının ve lokal adaptasyonlarının arabidopsis thaliana'da incelenmesi

Tohumlar çevresel işaretleri takip ederek çimlenmek için elverişsiz koşullardan kaçınır ve büyüme sezonunun içerisinde çimlenirler. Uyuşukluğun indüklenmesine ve salınmasına yol açan çevresel sinyallere olan duyarlılık tohumların genetiğine göre farklılık göstermektedir. Bu çalışmada yazın ve kışın büyüme gösteren iki Arabidopsis thaliana ekotipi arasında üretilmiş rekombinant kendilenmiş hatlardan oluşan haritalama popülasyonu bir tohum uyuşukluğu döngüsüne maruz bırakılmıştır. Popülasyon tepkisindeki fenotipsel çeşitlilikten yararlanılarak, tohum uyuşukluğu döngüsünün farklı yönlerini niteleyen 10 lokus keşfedilmiştir. Sonuçlara göre, birincil uyuşukluk halinin ve tohumların 5°C'de soğuğa maruz bırakılması ile oluşan ikincil uyuşukluk halinin etkisindeyken DOG1 25°C'deki çimlenme potansiyelini kontrol etmektedir. Fakat tohumların soğuğu takriben 25°C'de sıcağa maruz bırakılmasıyla oluşan ikincil uyuşukluk halinin etkisindeyken, 10°C'deki çimlenme potansiyeli DOG1 tarafından kontrol edilmemektedir. Bu koşullar altında çimlenmeyi kontrol ettiği tespit edilen Peak 5'in içerisindeki aday bir gen, ATHB-5, açık erişimdeki transkriptom verileri kullanılarak gerçekleştirilen bir ağ analizi ile tespit edilmiştir. ATHB-5 tohum uyuşuklukluğu döngüsünü kontrol eden lokal adaptasyonların potansiyel bir kaynağını teşkil etmektedir. Tohum uyuşukluğunu kontrol eden lokusların tespiti, dog1-2 ve mft2 ile üretilmiş yeni bir çift mutantın analizi, ve ağ analizinin sonuçları, Arabidopsis thaliana'da tohum uyuşukluğu döngüsünün regülasyonuna dair yeni bir perspektif sunmaktadır.