Classification of microRNA-disease associations and microRNA-species associations based on k-mer sequence representation

Düzensiz gen ekspresyonu, çeşitli hastalıkları beraberinde getirir ve mikroRNA'nın (miRNA) düzensizliğinin, hastalık gelişimi ve hücresel fizyoloji üzerinde geniş bir etkisi vardır. Bu nedenle miRNA'lar, insan hastalıklarıyla ilgili çeşitli temel ve önemli biyolojik süreçlerde önemli roller oynar. Birçok insan hastalığında miRNA'ların işlevindeki değişiklikler hakkında birçok araştırma yayınlanmıştır. Hesaplamalı yöntemler, potansiyel miRNA-hastalık ilişkilerini saptamak açısından birçok kaynak ve zaman gerektiren geleneksel ıslak laboratuvar deneylerini tamamlayıcı bir süreç olarak hizmet eder. Ayrıca, bilinmeyen bir miRNA'nın en olası türlerine atanmasına izin veren yeni bir yaklaşım sunmaya ihtiyaç vardır. Yeni verileri filtrelemenin kolay bir yolu, yeni miRNA'nın köken aldığı bilinen türlere olan maksimum mesafenin altında sınıflandırılmasını sağlamak olabilir. Bu tezde, miRNA'ları k-mer sekans gösterimleri ile betimleyerek ve makine öğrenme metodolojilerini kullanarak miRNA-hastalığı ve miRNA-tür ilişkilerini tanımlamak için bir hesaplama modeli önerilmiştir. Yaklaşımımızın farklılıkları, miRNA depolama bilgilerinin dizileriyle ilişkili hastalıkları ve türleri ortaya çıkarmamızdır. Bu, miRNA'ların kimyasal bileşikleri ve bunların farklı türler ve hastalıklarla ilişkileri hakkında bir soru ortaya koyar. Bu çalışma ile ortaya çıkan yeni hastalık-hastalık ve tür-tür ilişkileri birçok farklı tür ve hastalık için hesaplanabilmekte, bu yaklaşımlar tür ve hastalık sınıflandırmasını geliştirebilmektedir. Son olarak, çalışmamız günümüzde kullanılan tür ve hastalık sınıflandırmalarının yeniden tanımlanmasına kapı aralayabilir, ayrıca tedavi stratejilerinin geliştirilmesini ve erken teşhis edilmesini de sağlayabilir