Mitochondrial and nuclear dna phylogeographies for two botryllid ascidian species from the north-eastern mediterranean sea
2020
0 views
0 downloads
Advisor: Doç. Dr. Arzu Karahan
Abstract (TR)
Tüm dünya denizlerinde yaklaşık 3000 kadar türü bulunan asidiyanlar tulumlular içindeki en büyük gruptur. Botrylloides, dünyada yayılım gösteren botryllid tulumluları grubuna ait cinstir. Doğu Akdeniz'de total 6 Botryllid türü tespit edilmiştir. Fakat Türkiye'nin Akdeniz kıyılarındaki asidiyan dağılımları ve filocoğrafyası ile ilgili herhangi bir çalışma yapılmamıştır. Bu çalışma kapsamında, 2012 ve 2019 yılları arasında örnekler Hatay (Konacık), Mersin (Mezitli, Kızkalesi, Tisan) va Antalya (Alanya)'dan yaklaşık 550 km uzunluğu kapsayan kıyısal bölgeden toplanmıştır. Toplanan 62 örneğin COI bölgesi %100 başarı ile çoğaltılabilmiş fakat diğer belirteçler için amplifikasyon başarı oranı örnekleme istasyonlarına göre sıfır ile %100 arasında değişmiştir. Mitokondriyal (COI, CytB) ve nükleer (18s, H3) gen bölgeleri çoğaltılmıştır. Haplotipler/lokasyonlar için tür içi ve türler arası uzaklıklar hesaplanarak, median-joining network analizleri yapılmış ve filogenetik ağaçlar oluşturulmuştur. Neutrality test ve mismatch dağılım analizi herhangi bir demografik değişikliği belirlemek amacıyla yapılmıştır. Botrylloides ancep, Botrylloides sp. ve Botrylloides israeliense türleri ilk defa Levanten Denizi'nde Türkiye kıyılarında kayıt edilmiştir. Filocoğrafik analiz Tisan'dan tek bir örnekleme yapılan B. israeliense'nin tersine Konacık, Mezitli, Kızkalesi ve Alanya istasyonlarından birden fazlaörnekleme yapılabildiği için B. anceps ve Botrylloides sp. türleri için yapılabilmiştir. COI ve CytB gen bölgeleri B. anceps için, 18S gen bölgesi de Botrylloides sp. için varyasyon göstermemiştir. H3 geni B. anceps türü için varyasyon göstermişse de neutrality test ve Raggedness indeks istatistiki olarak önemli değerler vermemiştir. B. anceps türünün genetik varyasyonunun az olmasından dolayı istila edebilme kapasitesi düşük bulunmuştur ve bu durum bölgeye antropojenik yollarla tek girişin olması ve koloni yaşıyla ilişkilendirilmiştir. Botrylloides sp. türü için kullanılan iki mitokondriyal bölgede de varyasyon gözlenmiştir fakat P-değeri önemli olacak kadar değildir. Dolayısıyla, hem B. anceps hem de Botrylloides sp. türü için populasyonda büyüme gözlenmemiştir. Fakat Kızkalesi ve Mezitli'den toplanan Botryllodies sp. örnekleri arasında larvanın kısıtlı yayılım kapasitesinin sonucu olan güçlü genetik farklılaşma (FST=0.556COI, 0.361CytB) iki mitokondriyal bölge için de gözlenmiştir. B. israeliense ve Botrylloides sp. arasında farklı genotiplerde birden fazla koloni içeren kimerik oluşum gözlenmiştir. Çalışma ile türlerin blastogenik döngüleri, haftalık eşeysiz üreme, ilk kez tanımlanmıştır. Bu çalışmada, Türkiye'nin Akdeniz kıyılarında üç asidiyan türünün dağılımı verilmiştir ve populasyonlar filocoğrafik olarak karşılaştırılmıştır. Populasyonların sabit büyüklükte olduğu gözlemlenmiş ve belirteçlerin birlikte kullanılması gerektiği vurgulanmıştır.
Author
Dr. Esra Öztürk
Institution
How to Cite
Esra Öztürk (Yüksek Lisans Tezi). Mitochondrial and nuclear dna phylogeographies for two botryllid ascidian species from the north-eastern mediterranean sea, 2020, Middle East Technical University.
Keywords
License
Tüm Hakları Saklıdır
This work is shared under the specified license terms.
More theses from Middle East Technical University
- An R&D roadmap for Turkish defense industry(2020)
- Estimation of partially observed multiple graph signals by learning spectrally concentrated graph kernels(2021)
- Anticipation in collective motion of robot swarms(2021)
- Statehood struggle within the context of a protracted conflict; political economy of the Turkish Cypriot case(2021)
- Synthesis of spiro-pyrrolopyridazines(2021)
- Geochemical modeling of NCG injection in a geothermal well using doublet well model(2021)
