Effects of NKILA silencing on HSP90, NF-κB and β-catenin in MCF-7 cells

Meme kanseri günümüzde halen kadınlar arasında en sık rastlanan kanser tipi olup, ölüm oranları oldukça yüksektir. Normalde, kanser tedavisinde onkojenik proteinlere yönelik hedefli terapilere ağırlık verilmiştir. Ancak hedefli terapilerin başarısı kanser hücre hattına, hücre yüzeyi markırlarına ve hücrede apoptoz direncinin gelişimine bağlı olarak düşebilir. Yapılan son çalışmalar sadece proteinlerin değil, kodlamayan-RNA'ların da tüm kanser tiplerinde yer alabileceğini ortaya koymuştur. LncRNA'lar 200 den fazla baz çiftine sahip, kodlamayan RNA'lardır, mRNA'lara benzemekle beraber onlardan farklı olarak yapılarında ORF dizileri içermezler. Hücrelerdeki rolleri çok çeşitlilik göstermektedir ve birçoğunun proteinlerle etkileşime geçtiği bilinmektedir. NF-κB önemli bir transkripsiyon faktörü olarak kanser gelişimi ile direkt ilişkili bir proteindir ve bir lncRNA türü olan NKILA tarafından kontrol edilebilmektedir. NF-κB'nin negatif düzenleyicisi olarak tanımlanan NKILA hastalarda kötü prognoz ile ilişkilendirilmektedir. Günümüze değin, NKILA'nın çok az sayıda sinyal molekülü ile ilişkisi ortaya konulmuştur. Ancak, NKILA'nın diğer onkojenik proteinlerden HSP90α ve β-katenin ile ilişkisi henüz ortaya konulmamıştır. NF-κB ile bağıntılı olarak çalışan bu iki molekülün NKILA ile ilişkisinin aydınlatılması, kanser ilerleyişi hakkında önemli ipuçları sunabilir. NF-κB, Wnt sinyali ve ısı-şoku yanıt sistemi kanser ilerleyişi için birbiri ile korelasyonlu çalışabilir, çünkü NF-κB bu iki sinyal ağında da çakışma proteinleri vasıtasıyla etkili olabilir. Normalde, NF-κB HSP90 ile pozitif korelasyon gösterirken β-katenin ile olan bağıntısında çelişkili durumlar söz konusudur. Bu tez çalışmasında NKILA'nın daha önce incelenmemiş HPS90 ve β-katenin proteinlerinin anlatımları üzerindeki etkileri Western blot ve RT-qPCR yöntemleri kullanılarak araştırılmıştır. Elde ettiğimiz sonuçlara göre NKILA inhibisyonu, NF-κB protein kompleksini oluşturan alt ünitelerin ve HSP90 proteinlerinin ekspresyonlarında artışa, β-katenin ekspresyon seviyesinin ise azalmasına neden olmuştur. Bu bağlamda, NKILA'nın NF-κB gibi HSP90 ekspresyonu üzerinde de baskılayıcı bir rolü olduğunu söyleyebiliriz. β-katenin ekspresyonundaki azalma ise NF-κB seviyelerindeki artıştan kaynaklanıyor olabilir. Literatüre daha önce sunulmamış bu yeni bilgiler bize NKILA'nın moleküler mekanizmasını aydınlatmamızda önemli ayrıntılar verebilir ve ayrıca kanser tedavisi için yararlı yeni hedefler sunabilir.