Label-free tissue imaging using micro-raman spectroscopy

Bu tez, biyokimya alanında bulunan Hematoksilen ve Eozin (H&E) boyama gibi boyama tekniklerinin aksine plasenta ve uterus gibi farklı fare dokularının biyolojik kompartmanlarının etiketleme olmaksızın mikro-Raman spektroskopisi kullanılarak görüntü alınabileceğini göstermektedir. H&E boyalı dokular ile Raman küme haritaları kıyaslanarak, olgun fare plasental dokularının fonksiyonel bölgelerinin yalnızca Raman spektroskopisi ve kümeleme analizi kullanılarak gerçekleştirilebileceği başarıyla doğrulanmıştır. Spektral analiz yoluyla, biyokimyasal farklılıkları da tartışılmıştır. Ek olarak, boyutsal indirgeme ve kümeleme algoritması seçiminin nihai kümelemenin performansı üzerinde etkisi olduğu gösterilmiştir. İki bileşenin dağılım grafiklerinde t-SNE ve DBSCAN algoritmalarının diğer 25 kombinasyona göre daha üstün ayrılabilirlik sağladığı gösterilmiştir. Algoritmaların kombinasyonu belirlendikten sonra, hem implantasyon hem de implantasyonlar arası bölgelerden alınan dokuları analiz etmek için uygulanmıştır. Sonuçlar, beşinci günde implantasyon bölgelerinden alınan uterus dokularının, histolojik bulgularla uyumlu olarak, embriyonun bağlandığı bölgenin çevresinde belirli biyokimyasalların daha yüksek yoğunluk sergilediğini göstermiştir.