NLRC3: Enflamazom denetimi, hücre çoğalması ve immün ayrıcalık yolaklarının kesişimindeki yeni üye

NLR protein ailesi ödemi (enflamasyonu) denetleyen sitoplazmik almaçlardır. Cryopyrin gibi bazı NLR'ların enflamazom adı verilen kompleksler oluşturduğu ve patojeni tanıyıp enflamasyonu tetiklerken; aileyi oluşturan diğer NLR'ların görevi tam olarak bilinmemektedir. Bu az araştırılmış üyelerden biri olan NLRC3'ün, T hücresi aktivasyonunu baskıladığı, NFkB yolağını susturduğu ve STING'e bağlı sitokin salınımını olumsuz etkilediği belirlenmiştir. Bu tez kapsamında, NLRC3'ün Cryopyrin enflamazomunun düzenlenmesi, hücre çoğalması ve immün tolerans mekanizmalarındaki olası görevi araştırılmaktadır. Hücrelerde aşırı anlatımını sağlayarak veya shRNA ile susturarak, NLRC3'ün, Cryopyrin enflamazomuna bağlı IL-1β kesilim ve salımınını olumsuz etkilediği bulunmuştur. NLRC3'ün, yolakta Cryopyrin'in altında yer alan ASC ve pro-Caspase-1 proteinleri ile CARD bölgeleri sayesinde etkileştiği ve kompleks oluşumunu engellediği görülmüştür. Tezin ikinci bölümünde ise, NLRC3'ün kök hücre çoğalmasına etkisi araştırılmıştır. Nlrc3 seviyelerinin, tümöre daha yatkın olduğu bilinen Apc ve Apc Kras hücrelerinde azaldığı tespit edilmiştir. CRISPR/Cas9 tekniğini kullanarak Nlrc3 KO birincil dokular üretilmiş ve Nlrc3 KO, KD ve Nlrc3 aşırı anlatımı olan hücrelerin organoid oluşturma kapasitesi ölçülmüştür. Nlrc3'ün susturulması hücre çoğalmasını ve organoid oluşumunu arttırırken, Nlrc3'ü aşırı anlatan hücrelerde aksi fenotip gözlenmiştir. Nlrc3 susturulduğunda kök hücre (Lgr5) ve hücre çoğalması (CyclinD1) belirteçlerinin daha yüksek olduğu gösterilmiştir. Son olarak, Nlrc3'ün immün ayrıcalık dokularında ve hücre hatlarında anlatımının olduğu ve hücrelerin çekirdeğinde yer aldığı için bu dokularda transkripsiyon faktörü olabileceği öne sürülmüştür.