Kanser somatik mutasyonlarının protein-protein etkileşimleri üzerindeki etkisinin tahmini

Kanser, en büyük ölüm sebepler arasında yer alan karmaşık bir hastalıktır. Kanser araştırmalarında çözüm bekleyen bir sorun, kansere yol açan mutasyonların bulunduğu sürücü genlerin ayrıştırılmasıdır. Birçok biyolojik süreçler protein-protein etkileşimleri ile yürütülür. Bu nedenle, hangi somatik mutasyonların bu etkileşimlerde bir bozuculuğa sebep olduğunun anlaşılması kanser araştırması için oldukça önemlidir. Mevcut yöntemlerin çoğunda karşılaşan bir sorun, proteinde gerçekleşen bir mutasyonun, diğer tüm etkileşimlerinde aynı etkiyi gösterdiği varsayımıdır. Belirli bir mutasyonun oluşturduğu etkinin her etkileşimin ayrı tahmin edilmesi, hastalıkların gelişiminin anlanması açısından büyük bir öneme sahiptir. Bu tezde, Predator isimli model önerilmektedir. Predator, alternatif yöntemlerden daha iyi tahmin yapabilmektedir. Geliştirilen model, TCGA'de yer alan kanser verileri üzerinde uygulanmıştır. Predator, bu kanser mutasyonlarının protein-protein etkileşimleri üzerindeki etkisinin tahminini bozucu ve bozucu olmayan şeklinde sınıflandırması ve kansere yönelik analizleri yönüyle yenilikçidir. Bu analizler, kanser gruplarındaki bozucu etkisi olduğu tahmin edilen mutasyonla ilgili yeni bilgileri bulmada fayda sağlayabilecektir.