Investigating the role of coiled-coil domain containing 124 (CCDC124) in innate antiviral immune response

Doğal bağışıklık sistemi, organizmaların enfeksiyonlara ve tümörlere karşı öncül bağışıklamaya ihtiyaç duymadan oluşturduğu ilk adım savunma sistemidir. Doğal Öldürücü (NK) hücreleri, doğal bağışıklık sisteminin bir elemanı olup özellikle virüsle enfekte olmuş hücreleri ve tümörleri hedef alır. NK hücrelerinin özgül yetenekleri kanser immünoterapsinde kullanılmak üzere gelecek vaad etmektedir. Pek çok immünoterapi yaklaşımı arasından, bağışıklık sistemi hücrelerinde genetik modifikasyon ile bu hücrelerin aktivitelerini artırma üzerine çalışmalar yapılmış ve başarılı sonuçlar alınmıştır ancak NK hücreleri üzerinde yapılan in vitro genetik modifikasyon denemelerinin başarı oranları düşüktür. Bu sebeple NK hücrelerinde stabil gen transferi çalışmaları HIV-1 bazlı lentiviral vektörler üzerinde yoğunlaşmıştır. NK hücrelerinin virüslere karşı olan dirençleri, instabilite ve verimliliğin düşmesine sebep olmaktadır. BX795 gibi küçük molekül kinaz inhibitörleri ile yapılan çalışmalarda daha verimli viral transdüksüyon sonuçları elde edilebilmiştir. Bu çalışmada hücre içi stres granülleri ile ilişkisi olduğu düşünülen CCDC124 geni hedeflenmiş ve viral transdüksiyon sırasındaki antiviral rolü araştırılmıştır. Çalışmanın deneysel kısmında CRISPR/Cas9 sistemi kullanılarak HCT116, NK-92 ve YTS hücrelerinde CCDC124 geni ve diğer aday genleri susturulmuştur. Geliştirilen hücrelerin lentiviral transdüksiyon sırasındaki davranışları incelenmiştir ve lentiviral gen transferi yüzdelerinde önemli değişimler gözlenmiştir. Ek olarak CCDC124 geni susturulmuş olan NK-92 hücrelerinde stres granül oluşumuna bakılmıştır. Bu çalışmadaki bulgular NK hücrelerinde genetik modifikasyon yaklaşımlarının geliştirilmesine ve NK hücrelerinin virüslere karşı direnç mekanizmasının anlaşılmasına katkı sağlayacaktır.