Classification of spinal cord injury in rats by machine learning of gait parameters
2025
0 views
0 downloads
Advisor: Prof. Dr. Burak Güçlü
Abstract (TR)
Omurilik yaralanması (OY), duyu ve motor fonksiyonlarını önemli ölçüde et-kileyen, yüksek morbiditeye sahip kritik bir nörolojik durumdur. Bu tez, yürüme parametrelerinin ve lokomotor skorlamalarının makine öğrenimi tabanlı analizini kullanarak sıçanlarda OY sonrası geçen süreyi ve nörostimülasyon tedavi alımını sınıflandırmak için yeni bir yaklaşım sunmaktadır. Sıçan hareket görüntülerinden edinilen veri-lerle sınıflandırma doğruluğu ve yöntemin uygulanabilirliği açısından literatürdeki mevcut çalışmalarla karşılaştırmaktadır. Analiz edilen temel parametreler arasında Basso, Beattie and Bresnahan (BBB) lokomotor derecelendirme skalası ve Von Frey (vF) ge-riçekme eşiği gibi ölçümlerin yanı sıra basma fazı, salınım fazı, adım uzunluğu, basma fazı oranı ve pati alanı yer almaktadır. İşaretleyicisiz poz tahmin aracı olan DeepLabCut (DLC) ile sadece yanal görüntü odaklı metotlarla ilişkili zorlukların üstesinden gelinerek yürüme parametreleri çıkarıl-mıştır. Daha sonra yürüme parametreleri, BBB skorları ve vF eşik değerleri farklı algoritmalar kullanan Kollektif Öğrenme yöntemine öznitelik olarak verilmiş ve yaralanma sonrası süre ve deneklerin nöromodülasyon tedavisi alıp almadıkları öngörülmüştür. OY olan hayvanlarda ön ve arka ayaklardan elde edilen yürüme parametreleri ve BBB skorlarıyla yaralanma sonrası 6 farklı hedef sınıfı \%43 doğrulukla bulunmuştur. Aynı öznitelik kümesiyle tedavi ise \%71 doğrulukla öngörülmüştür. Sonuçlar, yöntemin tedavi gruplarını ve OY süresini sınıflandırmada etkili olduğunu göstermiştir. Ancak doğruluğu arttırmak için ek çalışmalar gerekmektedir. Derin öğrenme ile parametre çıkarımı OY araştırmaları için erişilebilir, uygun maliyetli çözüm sağlamaktadır.
Author
Perver Atilla İnce
Institution
How to Cite
Perver Atilla İnce (Yüksek Lisans Tezi). Classification of spinal cord injury in rats by machine learning of gait parameters, 2025, Boğaziçi University.
License
Tüm Hakları Saklıdır
This work is shared under the specified license terms.
More theses from Boğaziçi University
- Investigating the factors affecting the acceptance of generative artificial intelligence in business intelligence applications(2025)
- Entanglement of labor and environment in an emerging nuclear power landscape: The Akkuyu NPP(2023)
- Behind the gallows: Capital punishment, law, and legislative performance in Turkey (1926-1990)(2025)
- Exploring the values for nature, nature connectedness, pro-environmental behaviour, and well-being: A case study on urban park visitors in Istanbul(2025)
- An assessment on the role of regional development agencies in environmental governance in Türkiye: A case study on Thrace Region(2025)
- Political ecology of milk production in Türkiye: Changing practices, rural livelihoods, and dairy animals(2025)
