Şizofreni: ERBB4 ve NRG1 etkisinin hastalık gelişimi üzerine yeni bir kanıtı

En sık görülen ruhsal bozukluklardan biri olan şizofreni, kompleks bir hastalıktır; Mendel tipi kalıtım göstermez. ERBB4-NRG1 aksının rolünün bulunmasıyla, bu genlerin şizofrenideki hem bağımsız, hem de interaktif etkilerini gösteren birçok çalışma yayınlandı; fakat bu çalışmaların çoğunun sonuçları birbirini doğrulamadı. Bugüne kadar yayınlanmış olan 21 genom-çapı ilişkilendirme çalışmasının (GWAS) hiçbirinde bu iki gene ait SNP'ler anlamlı olarak gösterilemedi. Bu çalışma, üç GWAS'A ait verileri (CATIE, GAIN ve nonGAIN) kullanarak, şizofreniye neden olan moleküler yolaklarda görev alan ERBB4 ve NRG1 gibi genlerin genetik rolünü bulmak için yenilikçi bir in silico analiz yöntemi geliştirmeyi hedeflemektedir. Bu amaçla çalışma kapsamında, üç veri setinde de ERBB4 ve NRG1 genlerinin şizofreni ile ilişkilendiren bölgeleri, iki farklı haplotip-analiz yöntemi kullanılarak tanımlandı: Haplotip-tabanlı lojistik regresyon modeli ve Haploview yazılımı. Aynı yöntemler kullanılarak, daha önceki çalışmalarda, bu iki genin şizofreni ile ilişkilendirilen bölgeleri en az iki veri setinde doğrulandı. İlk defa bu çalışmada tanımlanan bölgelerin işlevsel etkilerini bulmak için, bu bölgelere bağlanan transkripsiyon faktörleri tanımlandı. ERBB4 ve NRG1 genlerinin bu bölgelerine bağlanan transkripsiyon faktörlerinin şizofreniye yatkınlık yaptığı ya da hastalıkta koruyucu etkisi olduğu gözlemlendi. Bu çalışma, ilk defa, GWAS veri setlerinde in silico ve biyoinformatik tabanlı işlevsel analiz yöntemleri kullanarak, intronik varyasyonların şizofreni üzerinde etkisini tanımlamaktadır. Tez kapsamında kullanılan yöntemlerin, intronik değişimlerin işlevlerini anlamak açısından yüreklendirici sonuçlar verdiği gösterilmiştir.