Thi-Qar ilinde idrar yolu hastalarından izole edilen Staphylococcus aureus'un bakteriyolojik ve moleküler çalışması

İdrar yolu enfeksiyonu (İYE), insanlarda görülen en yaygın bulaşıcı hastalıklardan biridir. Gram pozitif bir bakteri olan Staphylococcus aureus İYE' nın en sık görülen etkenlerindendir. Çalışmamızda İYE hastalarından izole edilen S. aureus'un izolasyonu ve identifikasonu sonrasında, kültürel ve biyokimyasal incelemeler ile moleküler genotiplendirmesi ve genetik varyasyonunu araştırılmıştır. Türlerin idendifikasyonunda API-20 ve Vitek2 kompakt sistemleri kullanılmıştır. Çalışmamızda, Şubat-Haziran 2021 ayları arasında Güney Irak, AL-Nasiriyah Şehrindeki AL-Hussein Eğitim Hastanesinde İYE şikayeti ile başvuru yapan 200 hastadan alınan idrar örnekleri değerlendirilmiştir. Alınan 200 hasta örneğinin 133'ünde (%66.5) Staphylococcus aureus pozitif olarak bulunmuştur. Suşların antibiyotik duyarlılıklarının belirlenmesinde klinikte sık olarak kullanılan on dört antibiyotik kullanılmıştır. Suşların en yüksek direnç oranları Ampisilin (%100), Sefoksitin (%97.7), Tetrasiklin (%76.6), Klindamisin (7%1.4) ve Trimetoprim-Sülfametoksazole (%54.1) olarak belirlenirken Eritromisin (%43.6) ve Doksisiklin (%42.8) olarak tespit edilmiştir. Diğer yandan, test edilen suşlar, Vankomisin ve Novobiyosine karşı yüksek derecede duyarlılık göstermiştir. İYE hastalarından izole edilen S. aureus'un virülans geni olarak (spa) geninin varlığını belirlemek için PCR tekniği kullanılmıştır. Tüm S. aureus izolatları (n=55), spa genine karşı (260-1400 bp) %100 oran ile pozitif reaksiyonla amplifiye edilmiştir. Ayrıca, bu genin genotiplenmesinde moleküler boyutu (538 bp) olan tst-1 geni tüm S. aureus suşlarının %20' sinde tespit edilmiştir. Bir DNA dizileme analizi yönteminde, S. aureus izolatları (IQ-İYE.1-IQ-İYE.2) ve NCBI-Blast ile ilgili v immünoglobulin G bağlayıcı protein A (spa) genindeki genetik varyasyon (ikame Mutasyonları) analizi S. aureus izolatı, (IQ-İYE.3) ve NCBI-Blast ile ilgili S. aureus izolatı, toplam genetik varyasyon yüzdesi (%0.23) aralığında bir ikame mutasyonu buldu.