DoctorateOpen Access

Kütle spektrometrisi temelli proteomik ve glikomik yaklaşımlar kullanılarak çeşitli yılan venomlarının moleküler izlerinin belirlenmesi

Is this your thesis?

This record came from a bulk archive import. If it’s yours, link it to your profile.

2023
0 views
0 downloads

Abstract (TR)

Viperidae zehrin türleri Türkiye'de geniş bir coğrafi bölgede yayılış göstermektedir. Spesifik proteom ve glikoproteom kompozisyon profilleri, zehrin biyolojik fonksiyonunu ve taksonomik sınıflandırmasını incelemek için kapsamlı bilgi sağlar. Bu bağlamda Viperidae familyasına ait beş zehirin proteomunda ve glikoproteomunda bulunan proteinleri karakterize etmek için proteomik, glikoproteomik ve glikomik stratejileri kullandık. Bulgu, her venom için, özellikle de glikoproteom profili için ayrı bir bileşim gösterdi. Genel kütle spektrometri profilleri, beş zehirin bileşiminde değişen 144 farklı protein, 36 glikoprotein ve 78 farklı N-glikan yapısını tanımladı. Glikoproteomiklerden elde edilen glikoprotein bileşimi verileri, glikomiklerden elde edilen bulgularla tutarlı bir şekilde uyumludur. Beş zehirde tanımlanan proteinlerin çoğu, glikosile edilmiş protein ailelerine, serin proteazına (SVSP), metaloproteazına (SVMP), C tipi lektinlere (CTL) aittir. Kümeleme ve temel bileşen analizleri (PCA), profileri proteomu, glikoproteom ve glikan profilleri arasındaki bileşime dayalı benzerlikleri ve farklılıkları gösterdi. Spesifik olarak M. xanthina (Mx) ve V. a.'nın N-glikan profilleri. Ammodytes (Vaa) zehirleri aynıydı ve ayırt edilmesi zordu; aksine proteom profilleri farklıydı. Kümeleme analizi, profileri türlerinin taksonomik sınıflandırmalarını sunarak farklı gruplara sınıflandırılmasını sağlamıştır. İlginç bir şekilde, profileri türleri arasındaki protein çeşitliliği, glikozilasyonun, zehrin proteomunda glikosile edilmiş protein çeşitliliği üzerindeki etkisini vurgulamaktadır. Önerilen bu yüksek verimli yaklaşım, çeşitli Viperidae zehirlerinin bileşimi ve işlevine ilişkin doğru ve kapsamlı profile.

Author

Marwa Abu Aısheh

How to Cite

Marwa Abu Aısheh (Doktora Tezi). Kütle spektrometrisi temelli proteomik ve glikomik yaklaşımlar kullanılarak çeşitli yılan venomlarının moleküler izlerinin belirlenmesi, 2023, Hacettepe University.

Keywords

License

Tüm Hakları Saklıdır

This work is shared under the specified license terms.

More theses from Hacettepe University