Yeni nesil dizileme ile DNA metilasyonuna dayalı adli yaş tahmini

DNA metilasyon tekniğine dayalı adli yaş tahmini çalışmaları son dönemlerde artış göstermektedir. Bu çalışmada 4-99 yaş arası 25 kişiden alınan yanak içi sürüntü örneğinde yeni nesil dizileme platformu ile 12 CpG bölgesinde (EDARADD, ELOVL2 RASSF5, MIR29B2CHG, FHL2, SMC4, TRIM59, LDB2, ELOVL2-AS1, CNTNAP2, ARHGAP22 ve CCDC102B) yaşa bağlı metilasyon seviyeleri araştırılmıştır. CpG bölgelerinin seçimi diğer araştırma grupları tarafından yayınlanan kısa listelere dayanmaktadır. Bir yaş tahmin modeli geliştirmek için doğrusal regresyon ve çoklu doğrusal regresyon kullanılmıştır. İstatistiksel değerlendirmede 10 CpG bölgesi (EDARADD, ELOVL2 RASSF5, MIR29B2CHG, FHL2, SMC4, LDB2, CNTNAP2, ARHGAP22 ve CCDC102B) için p değeri 0,02976 olup, istatistiksel olarak anlamlıdır. 5,1 yıllık Ortalama Mutlak Sapma ile kronolojik yaş ile tahmin edilen yaş arasında güçlü bir korelasyon tespit edilmiştir (R2=0,736; düzeltilmiş R2=0,5199). Çapraz doğrulanmış modelde, RASSF5 (p=0.033), MIR29B2CHG (p=0.034) ve SMC4 (p=0.0323) değişkenleri (CpG siteleri), %95 güven aralığında öngörücü değişken (Yaş) üzerinde önemli bir etkiye sahiptir. Bu eğitim veri seti ile çoklu R2 değeri 0,9878 (düzeltilmiş R2=0.9332) ve 2,3 yıllık Ortalama Mutlak Sapma ile kronolojik yaş ile tahmin edilen yaş arasında güçlü bir pozitif korelasyon gözlenmiştir. Bisülfit dizileme ile elde edilen metilasyon düzeylerinin doğruluğunu değerlendirmek için bu çalışmaya %0, %10, %25, %50, %75 ve %100 metilasyon olmak üzere yedi metilasyon standardı dahil edilmiştir. Beklenen metilasyon ile gözlenen metilasyon arasında güçlü bir korelasyon olduğunu gösteren 0.9887 R2 değeri elde edilmiştir. Bu sonuçlar metilasyon paternlerini ölçmede tekniğin güvenilirliğini ve kesinliğini göstermiştir.