Analysis of candidate molecular targets in adult (CML) and childhood (AML, ALL) leukemias

ÖZETADAY MOLEKÜLER HEDEFLERİN YETİŞKİN (KML) VE ÇOCUKLUK ÇAĞI(AML, ALL) LÖSEMİLERİNDE İNCELENMESİCemaliye Akyerli BoyluDoktora tezi, Moleküler Biyoloji ve Genetik BölümüTez Yöneticisi: Doç.Dr.Tayfun ÖzçelikMayıs 2004, 131 SayfaAday moleküler hedefler üç farklı lösemi tipinde incelenmiştir. Bunlar,kronik miyelositer lösemi (KML), akut miyelositer lösemi (AML) ve akut lenfositiklösemi (ALL)' dir. İlk moleküler hedef grubu yeni prognostik skorla sınıflandırılmışaltmış yedi KML hastasında cDNA'ya bağlı gen ifade profillerinin incelenmesi ilesaptanmıştır. Hastalar, yeni skorlama ile yüksek, orta ve düşük riskli olaraksınıflandırılmıştır. Risk gruplarının tedaviye cevapları farklıdır ve her grubun genifade profilleri bilinmemektedir. cDNA mikrodizilimleri kullanılarak iki yüksek veiki düşük riskli hasta karşılaştırılmış ve yedi adet gen seçilmiştir. Yarı-nicel vegerçek zamanlı ters yazılımlı polimeraz zincir reaksiyonu (RT-PCR) yapılmış vesonuçların cDNA mikrodizilimleri ile benzer olduğu gösterilmiştir. PTGS1 dışındakitüm genlerin ifadeleri, yarı-nicel RT-PCR sonucuna göre, istatistiksel olarak yüksek(n=9) ve düşük (n=7) riskli grup arasında anlamlı farklılık göstermektedir (IFITM1ve CXCL3 p=0.001; CCNH p=0.012; RAB1A p=0.01, PRKAR2B p=0.016; UCP2p=0.04; ve PTGS1 p=0.315). Gerçek zamanlı RT-PCR düşük (n=34) ve yüksek(n=11) riskli hastalarda IFITM1 için benzer sonuçları vermiştir (p=9.7976 x 10-11).Kaplan-Meier analizleri sonucunda yüksek IFITM1 veya düşük CXCL3 ifadelerininsağ kalımla ilişkili olduğu saptanmıştır (sırası ile p=0.01 ve p=0.059). Sonuçlarımız,gen ifade profillerinin risk gruplarının tanımlanmasında kullanılabileceğinigöstermekte ve ayrıca sağ kalımları belirlemekte yardımcı olabilmektedir.DNA onarım genlerindeki mutasyonlarla hematolojik hastalıklar arasındakiilişki iyi bilinmekle beraber, baz çıkarma onarım genlerinden insan E. coli mut Yhomoloğu MYH'deki eşey hücre mutasyonu kalıtsal bir kanser hastalığında ilk kezgeçtiğimiz yıl gösterilmiştir. Kanserle ilgili MYH mutasyonlarından Tyr165Cys veGly382Asp İngiliz kontrol populasyonunda yüksek sıklıkta (yüzde 1) gözlenmiştir.Bu bulgulara dayanarak, çocukluk çağı lösemileri olan AML (n=45) ve ALL (n=140)hastalarında yukarıda belirtilen mutasyonları kandan elde edilen DNA molekülündeinceledik. Mutasyonlar AML/M3 tanısı olan bir hasta hariç, diğer hasta örneklerindeve kontrolde saptanmamıştır. Tyr165Cys mutasyonu tanı sırasında alınan örnekteheterozigot olarak bulunmaktaydı. Remisyonda alınan örnek ve ebeveyn DNA'larıincelendiğinde sadece normal alel gözlenmiştir. Bu nedenle, mutasyonun lösemikblastlara özgü olduğu düşünülmüştür. Bu sonuçlar çocukluk çağı lösemileri ile MYHmutasyonları Tyr165Cys ve Gly382Asp arasında bir ilşki bulunabileceğinigöstermemiştir. Son olarak, bu mutasyonların kontrol grubunda gösterilememesiTürk toplumundan elde edilen sonuçların İngiliz toplumundan farklı olduğunudüşündürmüştür.iv