Antarktika Horseshoe adası'ndan izole edilen yeni aktinobakteri türlerinin tüm genom analizine dayalı polifazik karakterizasyonu ve biyoteknolojik potansiyellerinin araştırılması

Kutuplar, gezegenimizin en soğuk ve en gizemli bölgelerinden biridir. Kutuplar, sağladıkları ekstrem koşullar ve izolasyon koşulları sayesinde bölgesel mikroçeşitliliğe katkıda bulunurlar. Bu tür biyoçeşitlilik, benzersiz ve çok yönlü metabolik özellikler sayesinde potansiyel yeni metabolitlerin üretimine karşılık gelecek seviyededir. Bu bağlamda özellikle antibiyotik üretimi gibi biyoteknolojik potansiyeli ve değeri yüksek aktinobakterilerin, kutup ekstrem koşullarından izole edilmesi ve analiz edilmesi çok büyük önem arz etmektedir. Antarktika Horseshoe Adası'nın ilk aktinobakteriyel çeşitliliğini analiz eden bu çalışmada, adadan toprak, sediment ve su örneklerinden aktinobakterilerin izole edilerek yeni türlerin moleküler analizler ile tanımlanması ve polifazik yaklaşımla karakterize edilmesi amaçlanmıştır. Ayrıca biyoinformatik araçlar kullanılarak tanımlanmış yeni türlerin biyoteknolojik potansiyellerinin ortaya çıkarılarak literatüre kazandırılması amaçlanmıştır. Çalışmada, 18 seçici besiyeri kullanılarak Horseshoe Adası'nın 23 farklı lokalitesinden alınan örneklerden aktinobakteriler izole edilmiştir. Bu bağlamda 389 izolat saflaştırılmış ve morfolojik özellikleri incelenerek psikrofilik ve psikrotolerant 68 izolat 16S rRNA gen dizi analizleri ile cins düzeyinde tanımlanmıştır. 16S rRNA gen dizi analizleri sonucunda 20 farklı cins olduğu ve bunlardan 11'inin aktinobakteri üyelerine ait oldukları tespit edilmiştir. Bunlar arasından 31 izolatın yeni tür olma potansiyelinin yüksek olduğu değerlendirilmiş, bu izolatların hepsinin genotipik karakterizasyonları ile bazılarının kemotaksonomik ve fenotipik karakterizasyonları gerçekleştirilmiştir. Tez çalışması sonucunda, genomu dizilenen izolatlar arasından Micrococcus sp. H39-S4 izolatı haricindeki tüm izolatların yeni tür olma potansiyelleri olduğu, bu izolatların biyosentetik gen kümeleri ve metabolik potansiyelleri bakımından çok zengin oldukları gözlemlenmiştir. Bu tez çalışması sonunda polifazik analizi tamamlanan suşlardan yeni türler literatüre kazandırılacaktır.