Fosfolipaz A2 geni içerisinde bulunan SNP ile prostat kanseriarasındaki ilişki

Fosfolipaz A2 (PLA2) enzimleri, lipolitik enzimler olup hücre zarına bağlı olarak bulunan fosfolipitlerin parçalanarak biyolojik açıdan daha aktif olan ve enflamasyon, immün sistem, tümör oluşumu ve metastaz gibi olayları kontrol eden Arachidonic Acid (AA) ve lizofosfolipidlerin oluşmasını katalizlerler. Salınımlı Fosfolipaz A2-IIA (sPLA2-IIA) enzimi, bu enzim ailesinde bulunan Ca2+ bağımlı bir hidrolaz olup, prostat kanseri dahil bir çok hastalık durmunda artışı gözlemlenmiştir. sPLA2-IIA enziminin yüksek ifade seviyesi ileri seviye prostat tümör sınıflandırılması ve primer doku tümör proliferasyonu ile ilişkilendirilmiştir. Ayrıca serum içerisinde ki yüksek enzim seviyesinin, yüksek Gleason skoru ve ileri seviye hastalık evresi ile ilişkilendirilmesi sebebi ile, sPLA2-IIA enziminin bir prostat kanseri biyo-belirteci olarak kullanılabileceği öne sürülmüştür. Bu bağlamda bu tez dahilinde, prostat kanserinde ilk defa rs11573156 tekli nükleotid değişimi ile kanser gelişimi ve metastazı arasındaki bağlantı, sağlıklı popülasyon ile karşılaştırılarak incelenmiş olup, zararlı olabileceği düşünülen diğer tekli nükleotid değişimleri de bilgisayar destekli simülasyonlar ile incelenmiştir. Hastalardan alınan periferik kan örneklerinden DNA izolasyonu gerçekleştirilip ilgili gene ait sekanslama PCR-RFLP yöntemi ile yapılmıştır. Homoloji modellemesi yardımıyla dizayn edilen ve Ramachandran grafiği ile kalitesi belirlenen mutasyon modelleri ve doğal protein yapısı üzerinde moleküler dinamik simülasyonu gerçekleştirildi. Elde ettiğimiz sonuçlar ışığında rs11573156 tekli nükleotid değişikliği ile prostat kanseri arasında anlamlı bir ilişki bulanmamasına ragmen ilgili nükleotid değişiminin Türkiye popülasyonunda metastaz ile negatif yönde ilişkilendiği gösterilmiştir. Yapılan bilgisayar destekli modellemeler sonucunda araştırılan diğer iki tekli nükleotid değişiminin aktif bölge elemenları arasında kurulan bağlanmalara direct etkisi bulunmadığı görülmüştür. Lakin protein yüzeyinde meydana gelen yük değişimi dolaylı yoldan enzim aktivitesine etki edebilir ve daha detaylı incelenmesi gerekir.