Behçet hastalığı-genom analiz çalışmasında belirlenen IL23r-IL12RB2 bölgesindeki varyantın (RS924080), IL23R ve IL12rb2 genlerinin ekspresyonları ile ilişkisinin araştırılması.

Behçet hastalığı (BH), etiyolojisi bilinmeyen, tekrarlayan inflamatuar ataklar ile seyreden, artmış sitokin cevabına neden olan inflamatuar bir hastalıktır. 2010 yılında Remmers ve arkadaşlarının Türk toplumundaki Behçet hastalarında yürüttüğü GWAS çalışmasının sonuçlarına göre; IL23R-IL12RB2 lokusunda rs924080 SNP'leri BH ile ilişkili varyantlar olarak tespit edilmiştir (P <0.0001) ve Xavier ve arkadaşları tarafından 2012'de bir diğer çalışma ile konfirme edilmiştir. Bu tez projesinde Behçet Hastalığı-genom analiz çalışmasında belirlenen A risk alleli için Heterozigot (AG) (n=6) ve homozigot (AA) (n=4) taşıyan ve bu varyanta sahip olmayan sağlıklı kişilerin (GG) (n=4), IL23R-IL12RB2'nin intergenik bölgesinde yer alan varyantın (rs924080) artmış proinflamatuar cevaplarla ilgisi araştırılmıştır. Bu kişilerin periferik kanlarından elde edilen mononükleer hücrelerden hem hücre kültürü öncesi hem de hücre kültüründe IL23R ve IL12RB2 ekspresyonları için uyarıldıktan sonra RNA'ları elde edilmiş ve cDNA'ya çevrilmiştir. Real Time PZR ile IL-12RB2 ve IL-23R genlerin rölatif ekspresyonları araştırılmıştır. Her örnek Gliseraldehid-3-fosfat dehidrojenaz (GAPDH) referans geni ile karşılaştırılmıştır. Data analizi Ct metodu ile yapılmış olup, rölatif mRNA seviyeleri, az sayıdaki örnek grupları nedeniyle non-parametrik Kruskal-Wallis testi kullanılarak hesaplanmıştır. Bu çalışmada ilk kez BH ile ilişkili varyant olarak tespit edilen IL23R-IL12RB2 lokusundaki rs924080 tek nükleotid polimorfizminin, IL23R veIL12RB2 genlerine etkisi incelenmiştir. Bu yanıtlarda önemli olmasından dolayı, hastalık risk allelini taşıyan kişilerin (A), AA ve AG gruplarının IL-23R stimulasyon endeksleri GG grubuna göre anlamlı olarak yüksek bulunmuştur (p=0.042). Bu sonuçlara dayanarak, Risk A alleli, LPS ile uyarı sonucunda IL-12RB2, IL-23R, IFN- and TNF-'nın bazal ekspresyonunu etkilemiyor fakat IL-23R and TNF-'nın ekspresyon kapasitesini arttırarak yanıta neden oluyor ve baseline IL-6 üretimini arttırıyor. LPS stimulasyon sonuçlarına dayanarak, rs924080 A alleline sahip bireylerin bakteriyel patojenlere aşırı ve abartı inflamatuar yanıtlar veriyor olmaları da BH gelişimine destek oluyor diyebiliriz. Sonuçlarımız rs924080 lokusunun Th 17 ve IL-6 cevaplarında modulator bir yeri olduğunu göstermektedir.