Potential role and application of trehalose in the mirna dependent embryonic development of caenorhabditis elegans

MiRNA'lar neredeyse tüm biyolojik süreçlerde rol oynayan önemli bir protein kodlanmayan RNA sınıfıdır. Caenorhabditis elegans bir karasal nematoddur ve miRNA'lar bu organizmada bu organizmada bulunmuş ve neredeyse bütün gelişim süreçlerinde önemi gösterilmiştir. Çalışmada pash-1(mj100) suşu kullanılmıştır. pash-1 geni miRNA biyosentezinde görevli olan PASH-1 (PASHA) proteinini kodlamaktadır. pash-1ts suşunda sıcaklığın yükseltilmesiyle, miRNA biyosentezinin ilk aşamasının engellenmesinden dolayı miRNA üretilmemektedir. pash-1ts suşu, 25°C'de büyütüldüğünde erken yaşlanmaktadır. Ayrıca, pash-1ts suşunun 25°C'de üretilen embriyoların hiçbiri L1 evresine geçemez. miRNA'ların yaşlanmadaki rollerini anlamaya çalışırken kullandığımız kimyasalların biriyle son derece ilginç bir fenotip gözlemledik. Trehalozun varlığında pash-1 mutant hayvanlarının embriyonik ölüm fenotipi kurtarılabildi. Trehaloz, indirgeyici olmayan disakkarid [α-D-glukopiranosil- (1 → 1) -α-D-glukopiranozid] iki glükoz molekülü taşımaktadır. Trehaloz bakteriler, mayalar, mantarlar, böcekler, omurgasız ve bitkiler gibi çeşitli organizmalarda mevcuttur. Bu çalışmada, biz miRNA biyogenezinden yoksun C. elegans embriyogenezin üzerindeki trehalozun etkileri üzerinde duruldu. Trehalozun embriyo ölüm fenotipini neden hafiflettiğini anlamak amacıyla, trehaloza paralel olarak, çeşitli diğer kimyasallar da test edilmiştir. Ancak, diğer kimyasallar trehaloz gibi kurtarıcı etki göstermemiştir. Sadece, prolin ve serin trehalozla benzer etkilere sahiptir. Bu çalışmada ilk kez bir kimyasalın miRNA ilişkili bir fenotip üzerinde iyileştirici etkisi gösterilmiştir. Anahtar kelimeler: Trehaloz, C. elegans, miRNA'lar, embriyonik ölüm fenotipi, pash-1 (mj100)