Analysis of CHRNA5 expression in breast cancer cell lines in response to serum starvation and estrogen treatment

Meme kanseri karmaşık bir hastalık olup, moleküler olarak bazal, luminal A, luminal B, HER2+ ve normal tipler olarak sınıflandırılabilir. Bu tipler arasındaki ana fark hormon reseprörlerinin ifadeleri açısındandır. Farklı tip- lerin tedaviye cevapları da farklıdır. Bu nedenle, meme kanserini daha iyi sınıflandırabılmek için yeni moleküler markörler bulmanın önemi artmak- tadır. Kolinerjik nikotinik asetilkolin reseptörleri , sigara içme alışkanlığında, nörodejeneretiv hastalıklarda ve kanserde rolü olduğu düşülünen iyon kanal- larıdır. Kolinerjik reseptör nikotinik alfa 5 (CHRNA5) nikotin bağımlılığı ve akciğer kanseri ile ilişkilendirilmiştir ancak meme kanserindeki önemi henüz bilinmemektedir. Bu çalışmada, 10 adet meme kanseri hücre hat- tından oluşan bir panel kullanılarak, CHRNA5 varyantlarının ifadesi qPCR ile ölçülmüştür. CHRNA5 ifasesinin serum açlığı ve östrojen tedavisine bağlı değişimi incelenmiştir. qPCR sonuçları CHRNA5in meme kanseri hücre hat- larında alternatif kırpıldığını ve en az beş izoforma sahip olduğunu göster- miştir. Serum varlığında ve serum açlığında CHRNA5 ifadesini ölçen qPCR verilerinin analizleri aykırı verilerin bulunup çıkartılmasından sonra, TPT1 ve SDHA referans genlerinin geometrik ortalaması alınarak ANCOVA istatistik- sel analizi ile yapılmıştır. Sonuçlarımız gösteriyor ki, CHRNA5 ifadesi farklı tip meme kanseri hücre hatları arasında farklılık göstermektedir. Serum yokluğunda ZR-75-1 ve MDA MB 157 hücre hatlarında CHRNA5 ifadesi izoformlara özgü olarak anlamli bir değişime uğramıştır. Östrojen tedavisi sonucunda, CHRNA5 izoformlarının ifadeleri doz ve zamana bağlı olarak değişmektedir. Toplam CHRNA5 ifadesi ve izoform 2 CHRNA5 ifadesi 24 saatte, 12 saate göre artış göstermiştir. Bulgularımız CHRNA5in meme kanserinde birden fazla izoformu olduğunu ve bu izoformların serum açlığı ve östrojen tedavisi sonucunda, hücre hattına bağlı olarak değişme potan- siyelinin olduğunu göstermiştir. Anahtar sözcükler: meme kanseri, CHRNA5, alternatif kırpılma, östrojen,serum açlığı, moleküler tip.