Interactions between CRY1 and CBS mediate bidirectional regulation of circadian clock function and metabolism
2019
0 views
0 downloads
Advisor: Prof. Dr. İbrahim Halil Kavaklı
Abstract (TR)
Sirkadiyen ritim; fizyoloji ve davranışları 24 saatlik ritme senkronize ederek kontrol eder. Vücuttaki fizyolojik olayların senkronizasyonu, bizi hastalıklardan korurken hali hazırda var olan problemlerin de üstesinden gelmemize yardımcı olur. Işıkla kontrol edilen ve beynin SCN (suprakiazmatik çekirdek) bölgesinde bulunan merkez saatin aksine, organlarda yer alan periferal saatler merkez saat ya da beslenme sinyalleri ile kontrol edilir. Gen anlatımı ve protein anlatımının biyolojik saat tarafından kontrolü alanında yapılan yoğun çalışmalara rağmen, bu çalışmalar metabolitlerin yüzde 50'sinin osilasyonununun nasıl gerçekleştiğini açıklayamamaktadır. Moleküler seviyede sirkadiyen ritmin metabolizmayı nasıl kontrol ettiği ve protein anlatımı sonrası seviyede metabolik açıdan önemli proteinlerin sirkadiyen ritim tarafından nasıl kontrol edildiği hakkında çok az bilgi bulunmaktadır. Burada bahsedilen çalışmada, önemli bir metabolik enzim olan Sistation-beta-Sentez (CBS) ile sirkadiyen ritim negatif kontrolünden sorumlu olan kriptokrom 1 (CRY1) arasında yeni bir etkileşim keşfedilmiştir. CBS' in aktivite kaybına sebep olan mutasyonlar homosistinuria isimli çoklu-sistem hastalığına sebep olmaktadır. Bu iki protein arasındaki fiziksel etkileşim sirkadiyen ritim ve metabolizmanın karşılıklı kontrolünü sağlamaktadır. Çalışmamızda, CRY1' in gen anlatımı baskılayıcı rolünün yanında, yeni protein seviyesinde enzim aktivitesi kontrol edici rolü aydınlatılmıştır. CRY1, CBS'e bağlanarak ve onun oligomerizasyon yapısını düzenleyerek aktivitesini arttırmaktadır. Diğer taraftan, CBS CRY1'e bağlanarak onun gen anlatımı seviyesindeki baskılayıcı rolünü güçlendirmektedir. Buna ek olarak, insanlarda homosistinuria hastalığına sebep olan CBS mutasyonu da çalışmamız kapsamında araştırılmıştır. Mutant CBS (CBS-I278T) oligomerize olma yeteneğini kaybetmekle birlikte enzim aktivitesini de sürdürememektedir. Tüm bunların yanında, mutant CBS-I278T, CRY1 ile de etkileşememektedir. CBS-CRY1 etkiletişiminim fizyolojik önemini anlamak amacıyla da Cry1 nakavt ve Cbs nakavt farelerin karaciğer örneklerinde metabolomik çalışmalar gerçekleştirdik. Metabolomik çalışma sonuçları, organizmada CRY1 olmadığında ve CBS olmadığında ayni yolakların önemli ölçüde etkilendiğini gösterdi. Sülfür metabolizmasi, amino asit metabolizmasi ve üre yolağı CRY1 ve CBS tarafından önemli ölçüde etkilenen yolaklar olarak analiz edildi. Çalışmalarımız sirkadyen ritmin metabolizmayi protein etkileşimi seviyesinde nasıl kontrol ettiğine dair daha detaylı bilgi birikimine sahip olmamızı sağlamıştır. Çalışmamız sayesinde CBS-kaynaklı homosistinuria hastalığının tedavisinde sirkadyen bakış açisinin kazandırılması gerektiği de gösterilmiştir.
Author
Dr. Sibel Çal Kayıtmazbatır
How to Cite
Sibel Çal Kayıtmazbatır (Doktora Tezi). Interactions between CRY1 and CBS mediate bidirectional regulation of circadian clock function and metabolism, 2019, Koç University.
License
Tüm Hakları Saklıdır
This work is shared under the specified license terms.
More theses from Koç University
- International marketing strategies of Ekom-Eczacıbaşı in the Russian market(1995)
- The Balkans in an Age of Baroque transformations in architecture, decoration, and patterns of patronage ad cultural production in Ottoman Europe, 1718-1856(2006)
- Single machine scheduling with timelag constraints(2014)
- Ottoman olfactory traditions in a palatial space: Incense burners in The Topkapi Palace(2015)
- The connectedness of the Rum Seljuks and the Kingdom of Georgia: A framework for artistic exchance in the thirteenth century(2015)
- Turkish coffee fortune-telling ritual as a source of inspiration for designing object-mediated advice interactions(2017)
