A cryptocurrency incentivized voluntary grid computing platform for DNA read alignment

Yüksek çıktılı dizilemeye dair veri analizlerinde en temel sayısal sıkıntı okumaların referans genoma haritalanmasıdır ve bu iş için genelde bilgisayar kümeleri kullanılmaktadır. Lakin, petabaytlara varan bu veriyi işleyecek büyüklükte bilgisayar kümeleri kurmak imkansıza yakındır. Ayrıca, hataları gidermek ve yeni dizilenmiş insersiyonları eklemek için referans genom periyodik olarak güncellenmekte olup, bu durum bir çok büyük projede okumaların tekrar haritalanmasına ihtiyaç doğurmaktadır. Bu yüzden, programlama kümelerine olan ihtiyacı azaltmak için gönüllü örgü programlama teknolojilerini araştırmamız gerekmektedir. Ancak, okuma haritalama probleminin hesaplama gereksinimleri hatrı sayılır olması, analizin geri dönüşünün hızlı olması gerekliklerinden dolayı gönüllüleri motive edecek bir yönteme ihtiyaç duymaktayız. Bu sebepten dolayı, dağıtık okuma haritalama tekniklerini popüler blokzincir teknolojisi ile buluşturmayı öneriyoruz. Bitcoin gibi kripto paralar yeni blok üretimini zorlaştırmak ve kontrolde tutmak için "nonce" adı verilen bir değeri hesaplamayı mecburi kılar ancak bu sürecin başka herhangi bir kullanışlı amacı yoktur. Bizim çözümümüz (Coinami) yeni bir kripto para birimi olarak Halocoin'i sunuyor ve bu kripto para birimi bilimsel çalışmaları ödüllendirmeyi alternatif bir para basma yöntemi olarak sunuyor. Coinami, okuma haritalama problemlerini merkezi olmayan şekilde yayınlayıp dağıtarak gönüllüleri yaptıkları işten dolayı ödüllendirmeyi esas alır. Yetkili kurumlar sistemimizde iki temel şeyden sorumludur; 1) yeni problem kümeleri yayınlamak, 2) sonuçların kontrolünü sağlayıp sahte para basılmasının önüne geçmek.