Gene expression profiling of hedgehog pathway genes in epithelial cancers

Hedgehog (Hh) sinyal yolu birçok kanser tipinde incelenmiş ve önemli etkileri olduğugösterilmiştir ama meme, kolon ve karaciğer kanserlerinde kapsamlı olarakçalışılmamıştır. Bu çalışmada BCL2, SHH, SMO, IHH, PTCH1, GLI1, GLI2 ve GLI3 genifadesi profili 15 meme, 14 kolon ve 15 hepatoselüler karsinom (HSK) hücre hattında, 29primer meme tümörü örneğinde ve 3 eşleştirilmiş normal doku örneği havuzunda nicelgerçek zamanlı RT-PCR ile analiz edilmiştir. Meme hücresi hatlarının Hh yolundakihedef gen ifadesi düzeyi farklıdır ve bu yol sadece bazı meme karsinomu hücre hatlarındamuhtemelen liganddan bağımsız bir yolla aktive edilir. Çalışılan tüm meme kanserihatlarında PTCH1, SMO, GLI3 ve BCL2 ifadesi yüksek bulunmuştur. Hedef genlerinifade profilleri çalışılan meme hücresi hatlarının %93'ünde estrojen reseptörü durumunudoğru tahmin etmiştir. HSK hücre hatlarında Hh yolu gen ifadesi profili iyifarklılaşmamış HSK hücre hatlarını iyi farklılaşmış olanlardan Ayırdedici FonksiyonAnalizi (DFA) kullanıldığında kusursuz olarak ayırmıştır. Yüksek SMO ve IHHifadelerinin iyi farklılaşmış HSK hücre hatlarında normal dışı Hh yolu aktivitesi içinbelirteçler olduğu bulunmuştur. Kolon kanseri hücre hatlarında bazı genler içindüzenlemesi bozulmuş ifade profili gözlenmiştir. Primer meme tümörü örneklerindeörneklerin ER durumunun öngörülmesi ile bu çalışmaya dahil edilen genlerin ifadesiarasında çok kuvvetli bir ilişki bulunmuştur.Bu çalışma kanser hücre hatları ve meme kanseri doku örneklerinde Hh yolunun anahedef genlerinin transkripsiyonel gen ifadesi profillerini gösteren ilk kapsamlı çalışmadır.