Escherichia coli'de oksidatif stres ile ilişkili genlerin metal direncindeki rollerinin araştırılması

Bu çalışmanın amacı, bazı metallerin sebep olduğu stres altında, Escherichia coli'nin yaşamında oksidatif stres genlerinin rollerinin belirlenmesidir.Escherichia coli, doğada birçok stres faktörü ile başa çıkmak zorundadır. En önemlilerinden biri olan oksidatif stres, canlıların doğada ve aerob metabolizmalarının gereği oldukça sık karşılaştıkları bir stres faktörüdür. Bu stres ile başa çıkabilmek için birçok enzimatik ve enzimatik olmayan korunma mekanizmalarına sahiptir. Çalışmada Escherichia coli'nin oksidatif strese karşı korunmada rol alan sodA, sodB, sodC, katE, katG, ahpC, zwf, btuE enzimleri ile bu enzimlerin regülasyonunda görev alan oxyR, soxR, soxS düzenleyici genlerine sahip mutant bakteriler kullanılmıştır. Japon Ulusal Genetik merkezinden temin edilen Escherichia coli BW25113 mutantlarından P1 transdüksiyon ile mutasyon bölgeleri Escherichia coli W3110 bakterisine aktarılarak, mutant genlere sahip E. coli W3110 elde edilmiştir. Aynı şekilde Japonyadan temin edilen plazmitler doğrulama testleri için bu mutantlara transformasyon ile aktarılmıştır. Belirtilen genlerin metal direncindeki rollerinin analizi için; Cu, Zn, Ni, Co, Mn, Al, Pb, Cd, Cr, Mo, Hg metallerinin Minimal İnhibisyon Konsantrasyonu testleri, fosfat tamponunda Minimal İnhibisyon Konsantrasyonu değerinin yarısı ile metal varlığında yaşam deneyleri, farklı konsantrasyonlarda çeşitli metallerin bulunduğu katı besiyerlerinde ise farklı sayılarda bakteriler ile üreme testleri yapılmıştır. Önemli rol oynadığı belirlenen genlerin doğrulaması için plazmit transformasyonu yapılmış genlere sahip mutantlar ile aynı testler tekrarlanmıştır. Çalışma sonucunda, metal stresi altında oksidatif stres genlerinden sodB ve katE'nin metal direncinde en önemli gen bölgeleri olduğu belirlenmiştir. Bu ilişki ile literatüre, metal stresine karşı korunmada global mekanizmanın nasıl olduğuyla ilgili katkı sağlanmıştır. Anahtar kelimeler: Escherichia coli, Metal stresi, Reaktif oksijen radikali