Isolation, identification using phenotypic and genotypic methods and determination of some pathogenic characteristics of yersinia spp. from meat and milk products

Yersinia cinsi Enterobacteriaceae ailesine dahil olup ve 11 tür içermektedir. Bu cinse ait olan Y. pseudotuberculosis ve Y. enterocolitica insanlarda iyi bilinen iki enteropatojen olup kontamine gıda ve sular ile taşınırlar. Bu çalışmada, toplam 300 et ve süt ürünü toplanmış ve Yersinia türlerinin varlığını belirlemek için analizleri yapılmıştır. 300 örnekten 84'ü (%28) Yersinia spp. pozitif olarak bulunmuştur. 84 izolatın 18'i (%6) Y. enterocolitica olarak tanımlanmıştır. Tespit edilen diğer Yersinia türleri şunlardır: Y. rohdei 15 (%5), Y. intermedia 14 (%4,7), Y. pseudotuberculosis 12 (%4), Y. ruckeri 12 (%4), Y. mollaretii 5 (%1,7) ve Y. bercovieri 4 (%1,3). Ayrıca, 4 (%1,3) atipik Yersinia izolatının Yersinia cinsine ait olduğu doğrulanmış fakat Yersinia tür düzeyinde isimlendirilememiştir. Konvensiyonel olarak tanımlanan Y. enterocolitica suşları 16S rRNA amplifikasyonu ve dizi analizi ile de doğrulanmıştır. Yersinia türlerinin varlığı, et ürünlerinde %40,8 ve süt ürünlerinde %19,4 olarak bulunmuştur. Yersinia spp. tavukta %51,7 ve kıymada %30 olmak üzere en yaygın olarak et ürünlerinde saptanmıştır. Bu araştırmada türler arasında en sık rastlanan türün Y. enterocolitica olduğu ve bu türün de en fazla tavukta bulunduğu tespit edilmiştir. Tüm Y. enterocolitica suşları biyotip profilleri ve otoaglütinasyon, Kongo-kırmızısı bağlama ve kristal viyole bağlama gibi fenotipik virulans özellikleri için test edilmiştir. 1A olarak biyotiplendirilen Y. enterocolitica suşlarının hiçbiri fenotipik virulans testler sonucunda patojenik potansiyellere sahip bulunmamıştır. 18 Y. enterocolitica ve diğer 66 Yersinia suşları kromozomal (ail, ystA and ystB) ve plazmit DNA'da (yadA and virF) kodlanan genlerin varlığı bakımından genotipik olarak incelenmiştir. Bu çalışma, ne Y. enterocolitica ve ne de diğer Yersinia suşlarının, ail, ystA, yadA, ve virF genlerini taşımadığını göstermiştir. Y. intermedia suşlarının sadece birinin ve Y. enterocolitica suşlarının ikisinin ystB genine sahip olduğu bulunmuştur. 84 (%100) Yersinia suşunun tümü klindamisine direnç göstermiştir. Yersinia spp.'ler içinde en çok direnç %86,9 ile sefalotine, %78,6 ile sefazoline, %64,3 ile ampisiline ve %57,1 ile amoksisilline karşı tespit edilmiştir. En az üç veya daha fazla antimikrobiyal ajana karşı çoklu direnç suşların 71(% 84,5)'inde saptanmıştır. Bu çalışma, Yersinia spp. ve özellikle gıda kaynaklı patojen olan Y. enterocolitica'nın et ve süt ürünlerindeki varlığını, virulans özelliklerini ve antimikrobiyal direncini belgelemesi açısından önem arz etmektedir. Dolayısıyla, bu gıdaların üretimden tüketime kadar tüm süreçlerde sanitasyon açısından sıkıca denetlenmesi ve gıdaların kalitesinin iyileştirilmesi gereklidir.