
548
Arşivlenen Tez
0
DOI Atanmış
0%
DOI Oranı
Arşivlenen Tez
Digitalis türlerinden izole edilecek 3 beta HSD ve 5 beta POR genlerine ait promotorların Arabidopsis thaliana'da analizi
Digitalis ferruginea, known as foxglove, is famous for the production of secondary metabolites; i.e., cardiac glycosides. The progesterone 5β-reductase (5βPOR1 and 5βPOR2) and 3β-hydroxysteroid dehydrogenase (3β-HSD) are important key step genes in the pathway of biosynthesis of cardenolide in Digitalis species. For the first time, promoters of 3β-HSD, 5βPOR1 and 5β POR2 were isolated from genomic DNA of Digitalis ferruginea and sequence analysis was performed. Sequence information of the promoters revealed that these promoters have abundant cis-elements related to light responses. 5βPOR1promoter specific cis-elements are circadian and heat shock. 5βPOR2promoter specific regulatory elements are defense, stress and methyl jasmonate. Wound response element was found specifically in the 3β-HSDpromoter. Functional characterization of the 3β-HSDpromoter::GUS in Arabidopsis plants transformed by floral dip transformation showed activity in cotyledons, newly emerged leaves, vascular tissues of shoot and root, trichomes, shoot apical meristem (SAM) and hydathodes during plant growth and developmental stages. Under the treatments of 3% sucrose or 2% mannitol intensively enhanced GUS activity in the seedlings. In the presence of NaCl (150 mM) promoter expression activity was downregulated. 5βPOR1promoter::GUS activity was the highest in 5 and 10 days old seedlings in all tissues except root apical meristem, then decreased in 15 days old seedlings. 5βPOR2promoter::GUS activity was confined to vascular tissues in cotyledons in 5 and 15 days old seedlings. In 10 days old seedlings, promoter activity was intensively found in cotyledons, vascular tissues of cotyledons, hypocotyl and root adjacent to hypocotyl. Promoter activity was intensive in hypocotyl of 15 days old seedlings. The promoter sequences and functional characterization in Arabidopsis, revealed that the genes are light regulated and the 3β-HSD have role in plant growth, development and abiotic stress tolerance. Further, the genes 5βPOR1 and 5βPOR2 also have crucial role in normal plant growth during developmental stages.
Basit bütçe modelleri ile baraj göllerinde besin elementi değişiminin incelenmesi
Doğal ve yapay göllerde artan besin elementleri konsantrasyonu ötrofikasyonun ana nedenlerinden birisidir. Doğal ve yapay göllerin; besin elementlerince (fosfor ve/veya azot) ve organik maddece zenginleştirilmesi neticesinde su kütlesinde alg ve makrofit formlarının kontrolsüz büyümesi gerçekleşir ve neticede sucul ekosistemlerin yapısı, fonksiyonu ve istikrarında arzu edilmeyen değişiklikler ve su kalitesinde bozulmalar meydana gelir. Son 20 yılda, (a) basit ve tek denklemli ampirik (deneysel) bütçe modeli (Vollenweider, 1968); ve (b) daha detaylı üç boyutlu süreç temelli modeller olmak üzere doğal ve yapay göllerde besin maddesi değişimlerini nicelleştirmek için iki tür modelleme yaklaşımı geliştirilmiştir. Bu çalışma; baraj göllerinde basit bütçe modelleri ile besin elementi dinamiğinin incelenmesine odaklanmıştır. Çalışmanın temel hipotezi basit bütçe modelleri ile baraj göllerinde besin elementi tahminlerinin yapılabileceğidir. Bu amaçla Yuvacık Baraj Gölü'nde 2010-2014 yılları arasında yapılmış ölçümler kullanılarak bu hipotez test edilmiştir. Çalışmada kullanılan veriler Kocaeli Su ve Kanalizasyon İdaresi Genel Müdürlüğünden temin edilmiştir. Baraj Gölünde 2010-2014 yılları arasında TP konsantrasyonu 0.014 mg/L ile 0.065 mg/L arasında değişirken TN konsantrasyonu 0.67 mg/L ile 1.450 mg/L arasında değişmektedir. Çalışmada; Yuvacık Baraj Gölünün trofik seviyesi; Trofik Seviye İndeksine (TSI) göre belirlenmiş ayrıca Vollenweider tipi 9 farklı bütçe modeli ile TP ve TN konsantrasyonları tahmin edilmiştir. Bütçe modellerinin TN için R2 değeri % 20.02 ile % 29.70 arasında değişmektedir. TP için ise R2 değeri % 11.20 ile %57.20 arasında değişmektedir. Kullanılan bütçe modellerindeki katsayılar Yuvacık Baraj Gölü için özelleştirilmiştir. Bu özelleştirme işlemden sonra TN için R2 değeri % 23.72 ile %34.96 arasında değişmiştir. TP için ise R2 değeri %37.06 ile %57.79 arasında değişmiştir. Ayrıca Yuvacık Baraj Gölünde TP ve TN tahmini için model de geliştirilmiştir. Geliştirilen bu modellerin TN için çapraz validasyon belirleme katsayısı % 31.47 iken TP için bu değer % 60.71 olmuştur.
Giresun (Türkiye) ilinde sucul habitatlardan toplanan örneklerin, ostrakoda (crustacea) kabuğu, su kimyası ve sediment kimyası bakımından aralarındaki ilişkinin araştırılması
This study includes 105 different freshwater habitats were sampled from Giresun during 3-8 October 2015. Nine genera and 16 species were recorded from 69 of 105 sampling sites in Giresun. All species were new record for this province. Water and sediment samples from different aquatic habitat types were collected and analyzed to show possible relationship between abundance and effects on carapace structure of Ostracoda. Selected 17 carapace sample prepared for Energy Dispersive X-ray Analysis (EDX) and the percentages of the elements forming the carapace were determined. First two axes of Canonical Correspondence Analysis (CCA) revealed 69.5% of relationship between nine species and four environmental variables. Among variables, while water temperature (P<0.05) was the most effective variable, electrical conductivity, magnesium and nitrate were less effective variables. According to C2 analysis, Heterocypris salina has maximum optimum value for water temperature. Potamocypris fallax has minimum tolerance and optimum values for electrical conductivity. Sodium in the carapace structure of H. salina was found higher than other edx samples. There was no clear evidence of relationship between calcium concentrations at water and carapace. This finding suggets that major source of calcium in carapace was sediment through water.
Malatya (Türkiye) ilindeki ostrakoda türleri üzerinde ekolojik faktörlerin belirlenmesi
This study aimed to understand ecological effective on non-marine ostracod species in Malatya. Present study includes of 125 different water bodies randomly sampled from Malatya during 3-10 August 2015. Total of 25 living non-marine species (Candona neglecta, Cyclocypris ovum, Cypria ophtalmica, Cypridopsis vidua, C. lusatica, Herpetocypris brevicaudata, H. intermedia, Heterocypris incongruens, H. rotundata, H. salina, Ilyocypris bradyi, I. brehmi, I. gibba, I. inermis, Isocypris beauchampi, Limnocythere inopinata, Potamocypris fulva, P. unicaudata, P. variegata, P. villosa, Prionocypris zenkeri, Pseudocandona albicans, Psychrodromus fontinalis, P. olivaceus, Trajancypris clavata) were recorded and 24 of them were the new report for province. The most common species was I. bradyi and it collected from 24 sampling sites from all type of habitats. C. lusatica was found the first time in Turkey. Canonical corresponded Analyses (CCA) was applied to see correlation between species and ecological variables. The first two axes of CCA explained 66.1% relationship and most effective variables were salinity, water temperature and chloride on ostracods. C2 statistical analyses was applied to determine 15 species' (with 3 or more occurrences) tolerance/optimum value for 20 variables. UPGMA analyses showed 5 clustering group within 15 species. According to the results, ostracod species with relatively wide geographical ranges tend to show wide ecological tolerance ranges corresponding to a reduction to their optimum estimates.
Orta Kelkit Vadisinde doğal olarak yetişen alıç genotiplerinin( Crataegus spp ) seleksiyon yolu ile ıslahı
Orta Kelkit Vadisinde 2014-2015 yılları arasında, yörede doğal olarak yetişen Alıç (Crataegus spp.) türlerinin seleksiyon yolu ile ıslahı amacı ile yürütülen bu araştırmada üstün fiziksel özellikleri ile öne çıkan toplam 58 genotip meyve ve ağaç özellikleri; ümitvar bulunan 21 tip ise total şeker ve askorbik asit (C vitamini) içeriği yönünden incelenmiştir. Birinci yıl tüm saha gezilerek Alucra ilçesinde belirlenen 25, Şebinkarahisar ilçesinde 13, Suşehri ilçesinde 14, Koyulhisar ilçesinde 4, Mesudiye ilçesinde 2 adet olmak üzere toplam 58 alıç genotipi analiz edilerek 21 ümitvar genotip tespit edilmiştir. İkinci yıl tespit edilen ümitvar 21 genotip üzerinde ayrıca total şeker ve C vitamini içerikleri tespit edilmiştir. İki yıllık ölçümlere göre meyve ağırlıkları ortalama 1.48-7.67 gr, meyve eti ağırlığı 2.00-5.00 gr, et çekirdek oranı % 75.74-89.21, meyve boyu 12.62-20.70 mm, meyve eni 15.55-27.69 mm, çekirdek ağırlıkları 0.26-1.06 g, suda çözünebilir kuru madde (SÇKM) oranı % 11.75-20.00, pH değeri 3.59-4.36 ve titre edilebilir asitlik değeri % 0.27-1.50 arasında bulunmuştur. İkinci yıl ölçümlerine göre total şeker miktarı 2.52-21.18 g/100g, askorbik asit içeriği 7.92-20.88 mg/100g olarak bulunmuştur.
Kısmi sıralı sıra birimi olan vektör uzayındaki bandlar
This thesis consists of four chapters. In chapter I,II it is given some neccesary definitions, which is used in other chapters. In chapter III, we deal with some basic properties of Riesz spaces, and characterizations of bands of C(Ω)-spaces, which is one of the fundemental example of Riesz spaces, are given. In the last chapter, the notion of directed partially ordered vector spaces are introduced and also the notion of bands are given in terms of disjointness. Bands are studing via Riesz space cover X of Y on the condition X with order unit Y can be express as C(X), here X compact and T2 space. one can express bands in X, seperate complement as subset of X
Fermente sucukta ıspanak ve maydanoz tozları kullanılarak sentetik nitrit miktarının azaltılabilme imkanlarının yanıt yüzey yöntemi ile modellenmesi
Bu çalışmada amaç, ıspanak ve maydanoz tozlarından istifade ederek geleneksel yöntemle üretilen fermente sucuklarda kullanılan sentetik nitrit miktarının azaltılması ve bu faktörlerin etkisinin matematiksel modellenmesidir. Piyasadan tedarik edilen ıspanak ve maydanoz tozlarının ihtiva ettikleri nitrat ve nitrit miktarları iyon kromatografisi ile tespit edilmiştir. Sucuk üretiminde kullanılan ıspanak ve maydanoz ekstraktlarının kullanım miktarları yanıt yüzey yöntemi (YYY) ile belirlenmiştir. YYY'ne göre belirlenen muamele kombinasyonları 14 grup şeklinde oluşturulmuştur. Fermente sucuk üretimi geleneksel yöntemle gerçekleştirilmiş ve üretilen sucuklar 30 gün olgunlaştırmaya bırakılmıştır. Olgunlaştırma işleminden sonra renk tayini, pH tayini, kalıntı nitrit tayini, yağ tayini, nem tayini, protein tayini, TBA tayini ve peroksit tayini yapılarak kontrol grubu ile karşılaştırmaları yapılmıştır. Elde edilen sonuçların istatistiksel analizleri Box- Behnken yöntemine göre yapılmıştır. Yapılan analizler sonucunda, ıspanak tozunun peroksit, Liç*, aiç*, a*(kabuk), b*(kabuk), NH4+ değerlerini etkilediği, maydanoz tozunun ise peroksit, TBA, L*(kabuk), b*(kabuk), NH4+ ve NO3- değerleri üzerine etkisi olduğu görülmüştür. Fermente sucuğa ilave edilen sodyum nitrit, TBA, b*(kabuk), a*(kabuk) ve NO3- değerlerini etkilediği tespit edilmiştir. ANAHTAR KELİMELER: Fermente Sucuk, Nitrit, Nitrat, Ispanak, Maydanoz, Yanıt Yüzey Yöntemi, İyon Kromatografisi
Fermente sucuk üretiminde pancar ve üzüm çekirdeği tozu kullanılarak sentetik nitrit miktarının azaltılabilme imkanlarının yanıt yüzey yöntemi ile modellenmesi
Bu çalışma; geleneksel yöntemle üretilmiş fermente sucukta kullanılan sentetik nitrit miktarının azaltılabilmesi ve fermente sucuğun çeşitli fiziksel, kimyasal ve teknolojik özellikleri üzerinde sodyum nitrit, pancar tozu ve üzüm çekirdeği tozu etkisinin saptanması ile bu etkilerin, Box-Behnken modeli kullanılarak yanıt yüzey yöntemine (Response Surface Methodology) göre modellenmesi amaçlanmıştır. Araştırmada, hammadde olarak yağsız dana eti, kuzu kuyruk yağı, sığır yağı, çeşitli baharatlar ve sodyum nitrit (0-150 ppm), pancar tozu (%0-0.5), üzüm çekirdeği tozu (%0-1) kombinasyonları kullanılarak fermente sucuklar hazırlanmış ve hazırlanan bu sucuklarda fermentasyon boyunca ve 30 gün olgunlaştırma işleminden sonra bazı fiziksel, kimyasal ve teknolojik analizler yapılmıştır. Fermente sucuk üretiminde sodyum nitrit kullanımını azaltmak amacıyla ilave edilen pancar tozunun pH, TBA, a*(kabuk), NH4+, NO3- ve randıman etkisinin önemli olduğu bulunmuştur. Kullanılan üzüm çekirdeği tozunun peroksit sayısı, a*(iç), a*(kabuk), NO3-, SO4-, NH4+ ve randıman üzerinde etkili olduğu bulunmuştur. Kullanılan sodyum nitritin ise pH, peroksit sayısı, TBA, a* (iç), SO4-, üzerinde etkili olduğu bulunmuştur.
Fermente sucuk üretiminde kereviz ve kuşburnu tozları kullanılarak sentetik nitrit miktarının azaltılabilme imkânlarının yanıt yüzey yöntemi ile modellenmesi
Bu çalışma; geleneksel yöntemle elde edilen fermente sucukların çeşitli fiziksel, kimyasal ve teknolojik özellikleri üzerinde sodyum nitrit, kereviz tozu ve kuşburnu tozunun etkisinin saptanması ve bu etkilerin Box-Behnken modeli kullanılarak Yanıt Yüzey Yöntemine (Response Surface Methodology) göre modellenmesi ve kullanılan sentetik nitrit miktarının azaltılabilmesi amacıyla yapılmıştır. Yapılan bu araştırmada, hammadde olarak yağsız dana eti, kuzu kuyruk yağı, sığır yağı, çeşitli baharatlar ve sodyum nitrit (0-150 ppm), kereviz tozu (%0- 2), kuşburnu tozu (%0-2) kombinasyonları kullanılarak fermente sucuklar hazırlanmış ve hazırlanan bu sucuklarda fermentasyon boyunca ve 30 gün olgunlaştırma işleminden sonra bazı fiziksel-kimyasal ve teknolojik analizler yapılmıştır. Fermente sucuk üretiminde sentetik sodyum nitrit kullanımını azaltmak amacıyla ilave edilen kereviz tozunun pH, peroksit sayısı, TBA, L*(iç), NH4+, NO3-, SO4-2 değerleri ve randıman üzerindeki etkisinin önemli olduğu bulunmuştur. Kullanılan kuşburnu tozunun pH, L*(iç), b*(iç), a*(kabuk) değerleri üzerinde etkili olduğu saptanmıştır. Kullanılan sodyum nitritin ise nem, peroksit sayısı, TBA, a* (kabuk), b* (kabuk), NO3- ve randıman değerleri üzerinde etkili olduğu bulunmuştur.
Polikristal tür bir fotovoltaik panelin I-V karakteristiğinin analitik modellenmesi ve deneysel validasyonu
Fotovoltaik hücreler, güneşten gelen elektromanyetik enerjiyi elektrik enerjisine dönüştüren enerji dönüşüm sistemleridir. Bu çalışmada 40°42'52.2"K, 31°31'29.8"D koordinatlarında kurulu bulunan 36 hücreli polikristal tür bir güneş paneli, çeşitli sensörler ve veri kaydedici cihazlar kullanılarak hazırlanan deney düzeneği temelinde; i) Güneş ışınım şiddetinin fotovoltaik panel üzerindeki etkisinin incelenmesi, ii) fotovoltaik panelin akım-voltaj karakteristiğinin incelenmesi, iii) fotovoltaik panelden elde edilen akım-voltaj eğrilerinin literatürdeki modeller ile karşılaştırılması ve validasyonu amaçlanmıştır. Söz konusu fotovoltaik panel için farklı güneş ışınım şiddetinde ve farklı sıcaklıklarda ölçülen akım-voltaj karakteristikleri; 4-değişkenli, 5-değişkenli, geliştirilmiş 4-değişkenli ve 2-diyotlu model olmak üzere toplam 4 farklı analitik model kullanılarak modellenmiş ve doğrulanmıştır. Akım-voltaj ilişkisini tanımlayan analitik denklemler Visual Basic programlama dili kullanılarak çözümlenmiştir. Modellerden elde edilen sonuçlar ile ölçülen değerler arasındaki karşılaştırma R² ve RMSE olmak üzere 2 istatistiksel parametre üzerinden gerçekleştirilmiştir. Elde edilen sonuçların istatistiksel analizi; bu tez kapsamında kullanılan 4 farklı model içerisinde, geliştirilmiş 4-değişkenli modelin diğer modellere göre daha başarılı tahmin sonuçlarına yol açtığını göstermektedir.