Kendiliğinden kümelenen peptit yapılarının deneysel olarak incelenmesi ve uygulamaları

Günümüz dünyasında peptit kimyası ve uygulamaları, biyoteknolojinin bazı temel alanlarındandır. Bu da, yeni biyomühendislik araçlarının geliştirilmesinde yeterli miktarda ilginin oluşmasını sağlamaktadır. Özellikle, nanoteknolojinin hayatlarımıza girmesi, araştırmacılara 'nano-boyutta' karakterizasyon kazandırmış olup, araştırılacak daha çok soru ve daha çok cevap getirmiştir. Nanoteknolojinin kazandırdıkları ile, moleküllerin moleküller arası etkileşimler ile dinamik davranışlarını anlamak için 'kendi kendine kümeleşme', araştırma alanında bir kavram olarak gelişmiştir. Peptitler doğal olarak bulunabilen ve proteinlerin küçük parçaları olan moleküllerdir ve makroyapılar oluşturmak üzere kendi kendine kümeleşme eğiliminde olabilirler. Mevcut çalışmada küçük oligopeptitler ele alınmıştır. Apolar Alanin amino asidinin pozitif yüklü Lizin ile oluşturduğu peptit dizileri incelenmiştir. Dolayısıyla, Ala-Ala-Ala-Ala-Ala-Ala-Lys (A6K)ve Ala-Ala-Ala-Ala-Ala-Ala-Ala-Ala-Ala-Ala-Lys (A10K) çalışılmış olan model peptitlerdir. A6K hem su hem de döteryumlu su içerisinde çözülerek incelenmiştir. Ayrıca kendi kendine kümeleşmeye pH değişiminin etkisi de NaOH eklenerek çalışılmıştır. A6K'nın solüsyon içerisinde kendi kendine kümeleşme özellikleri görüntüleme ve saçılma teknikleri kullanılarak analiz edilmiştir. Oluşan makroyapıları sınıflandırmak için A6K peptidine genişletilmiş bir faz diyagramı oluşturulmuştur. Peptit molekülü, bir iyon değiştirici ile taşındığı için, elektrostatik etkiler, tri-floro asetat ya da klorür gibi farklı iyon taşıyıcılar kullanılarak incelenmiştir. Çalışmada uygulama için, model peptit olarak A10K seçilmiştir ve sitotoksisitesi araştırılmıştır. A10K'nin kendi kendine kümeleşmesi daha önce çalışılmıştır. Deneysel çalışma boyunca, fibroblastlar (TM3 ve HDF), epitel hücreleri (Vero), endotel hücreleri (HUVEC), ve keratinosit (HaCaT) gibi hücre hatlarıyla çalışılmıştır. Sonrasında, A10K çözeltisi ile hücre kültüründe yara iyileşmesi incelenmiştir.