Molecular characterization and isolation of avian influenza a viruses from wild aquatic birds in Gediz delta

Türkiye, bulunduğu konum itibarı ile her yıl binlerce kuş tarafından ziyaret edilmektedir. Farklı kökenlerden gelen bu kuşların sulak alanlarda bir arada bulunması, influenza A virüslerinin (IAV) evrimine ve yayılmasına katkı sağlamaktadır. Bu sulak alanlardan biri olan Gediz Deltası, farklı kuş türlerinin yanı sıra birçok memeliye de ev sahipliği yapmakta, böylece IAV'lerin memelilere adapte olması için gerekli ortamı sağlamaktadır. Dolayısıyla bu çalışmanın amacları; deltadaki yabanıl kuşlar tarafından taşınan düşük patojenli IAV'lerin prevelansının saptanması, bu virüslerin genomundaki zoonoz ve salgın riski taşıyan belirteç mutasyonların tespit edilmesi, ayrıca virüslerin antijenik genlerinin coğrafi kökenlerinin belirlenmesidir. Bu bağlamda İzmir Kuş Cenneti/Gediz Deltası'nda konaklayan yabanıl su kuşlarının dışkılarından 500 adet örnek toplanmış, moleküler metotlar kullanılarak deltadaki IAV prevalansı saptanmıştır. Sonrasında virüs izolasyonu için IAV pozitif örnekler embriyolu tavuk yumurtalarına inoküle edilmiş ve bir virüsün tüm genom analizi gerçekleştirilmiştir. Çalışmanın sonucunda IAV'lerin İzmir Kuş Cenneti/Gediz Deltası'ndaki matriks gen amplifikasyonuna dayalı prevalansı %31.2 olarak tespit edilmiş ve dört adet virüs izole edilmiştir. Alt tipi H6N2 olarak belirlenen bu virüsün tüm genom analizi sonucunda, virus genomunda zoonoz ve kümes hayvanlarına adaptasyon riski taşıyan 32 farklı belirteç mutasyon tespit edilmiştir. Ayrıca yapılan filogenetik analizler virüsün antijenik genlerinin Asya kökenli olduğunu göstermiştir. Bu çalışmanın sonuçları, deltada sirküle eden IAV'lerin insan ve hayvan sağlığını tehdit eden mutasyonlar taşıdığını ortaya koymuştur.