Organokatalizör veritabanı oluşturulması ve sanal taraması

Organokataliz asimetrik sentezlerde nispeten yeni fakat yaygın olarak kabul gören bir alandır. Organokatalitik stratejiler, sürdürülebilir kalkınma için endüstride umut verici çözümler olarak ortaya çıkmıştır, çünkü organokatalizörler düşük maliyetlidir, hafif reaksiyon koşulları altında yüksek seçicilik sağlarlarlar ve çevreye daha az atık üretirler. Organokataliz ile ilgili yayınların sayısı son on yılda nefes kesici bir şekilde artmıştır. Organokatalizlerin çeşitliliği ve sayısı arttıkça, bu sayıda bilgiyi etkili bir şekilde yönetmek ve verilerin erişilebilirliğini arttırmak için bir veritabanına ihtiyaç duyulmaktadır. Bu nedenle, bu proje organokatalizörlerin fiziksel ve kimyasal özelliklerini, ticari kullanılabilirliklerini, sentetik yollarını, katalize ettikleri reaksiyonları ve üç boyutlu (3D) konformasyonel kütüphanelerini içeren bir organokatalizör veritabanı oluşturmasını ve bu veritabanını tarayarak hedef reaksiyonlar için potansiyel organokatalizör adaylarını belirlenmesini amaçlamaktadır. Başlangıç olarak yapılarında farklı fonksiyonel gruplar taşıyan toplam 55 kinkona alkaloid dikkate alınmış ve bunların özellikleri, piyasadaki kullanılabilirlikleri, katalitik ve sentez reaksiyonları, üretilen organokataliz veritabanına kaydedilmiştir. Veritabanı, oksindol ile nitrosobenzen ve dimetil malonat ile nitrostiren reaksiyonları için kuantum mekanik olarak optimize edilmiş aktif bölge modellerinden elde edilen katalitik atom haritaları kullanılarak sanal olarak taranmıştır. Eşleşen moleküller, hedef reaksiyon için potansiyel organokatalizler olarak önerilmiştir. Organokatalizör veritabanının hesaplamalı taraması stratejisi, çok sayıda organokataliz türevinin külfetli sentezi ve faaliyetlerinin test edilmesi yerine, deneysel testlerden önce, olası katalitik yapıların uygun maliyetli bir şekilde belirlenmesine ve mevcut tüm bilgilere kolaylıkla erişilmesini sağlayacaktır.