Investigating genetic variation and population structure of A. lignicolus (Hartig, 1840)using mitochondrial DNA
2013
0 views
0 downloads
Advisor: Doç. Dr. Serap Mutun
Abstract (TR)
Meşe taksonları ile gal arısı Andricus lignicolus Anadolu tür çeşitliliğinin birer parçasıdır. Andricus lignicolus türünün eşeysiz nesil galleri Q. Robur, Q. Petraea ve Q. Pubescens türü meşelerde oluşturulur. Bu tezde A. lignicolus?un genetik çeşitliliği, filogenetik ve filocoğrafik yapısı ve populasyonlar arası genetik farklılaşması araştırılmıştır. Bu amaçla, 15 populasyondan 117 bireyin mitokondri DNA?sı izole edilmiş ve mitokondriyal sitokrom b geninin 433 baz çiftlik bölgesi çoğaltılmıştır. Dizilime işleminden sonra 18 haplotip belirlenmiştir. Haplotiplerde varyasyon gösterirken 58 karakterden 21?I bilgi sağlayıcı değildir, ancak 37 karakter filogenetik olarak bilgilendirici bulunmuştur. Andricus lignicolus haplotiplerinde, nükleotid frekansları sırasıyla A, C, G, T bazları için %34, %11, %9 ve %44 olarak bulunmuştur. Substitüsyonlar arasında 30 transisyon ve 20 transversiyon tespit edilmiştir (ti/tv= 1.5). Ortalama haplotip ve nükleotid çeşitliliği 0,32519 ve 0,0087955 olarak hesaplanmıştır. En yüksek haplotip çeşitliliği Kütahya populasyonunda (h= 0,7778) ve en yüksek nükleotid çeşitliliği Uşak populasyonunda (?=0,042494) bulunmuştur. Uyumsuzluk dağılım analizi ile çalışılan A. lignicolus populasyonlarının genetik dengede olduğu gözlenmiştir. AMOVA analizi araştırıcının daha önceden belirlediği gruplara moleküler varyasyonun hiyerarşik olarak dağılımını belirler. Yapılan farklı gruplandırma denemelerinden istatistiksel olarak en anlamlı ve yüksek değerin populasyonlarca paylaşıldığı bulunmuştur (% 71.43 herbir populasyon karşılaştırıldığında). Filogenetik analizler maksimum olasılık ve maksimum tutumluluk uygulamaları doğrultusunda yürütülmüştür. Elde edilen sonuç ağaçları yüksek bootstrap değerleriyle desteklenen iki temel klad ayrımı gösteren aynı topografiyi vermiştir. Bayesian analizi önemli bazal gruplaşmaların olmadığı ve daha çok politomi içeren ağaçla sonuçlanmıştır. Parsimoni network analizi en büyüğü A. lignicolus haplotiplerinin yarısını içeren 4 haplogrup üretmiştir. Genel olarak ele alındığında bu tezde elde edilen veriler Türkiye?deki A. lignicolus türünün tür içi filogenisi ile beraber genetik çeşitlilik ve populasyon yapısına da ışık tutmaktadır.
Author
Dr. Hülya Karagözoğlu
How to Cite
Hülya Karagözoğlu (Yüksek Lisans Tezi). Investigating genetic variation and population structure of A. lignicolus (Hartig, 1840)using mitochondrial DNA, 2013, Bolu Abant Izzet Baysal University.
Keywords
License
Tüm Hakları Saklıdır
This work is shared under the specified license terms.
More theses from Bolu Abant Izzet Baysal University
- Sosyal bilgiler öğretmen adaylarının demokratik katılım düzeyleri ve demokratik katılıma ilişkin görüşleri(2023)
- Modernleşme ve toplumsal değişim bağlamında Türk ordusunun sosyolojik analizi(2025)
- Seçim kampanyalarında amerikanlaşmanın seçmenin oy verme davranışına etkisi-Düzce örneği(2025)
- Zihinsel yetersizliği olan öğrencilere çarpma öğretiminde somut-yarı somut-soyut öğretim stratejisinin etkililiği(2016)
- Fen bilgisi öğretmen adaylarının çevre sorunlarına ilişkin görüşlerinin farklı teknikler kullanılarak tespit edilmesi(2010)
- Mühimme Defterleri'nde Bolu Sancağı ve Bolu'da eşkıyalık ( H961-993, M 1553-1585)(2010)
