Fare birincil miyotüp hücrelerinde RNA-seq ile oncostatin M hedef genlerinin tanımlanması

Kanser kaşeksisi , iltihap ve yağ ile iskelet kası dokularının kaybıyla belirtiliran bir zayıflatıcı yıkım sendromudur. Kanser ölümlerinin yaklaşık %20'si kaşeksiden kaynaklanırken, mevcut etkili tedaviler yoktur ve kanser kaşeksisinin altında yatan moleküler mekanizmalar belirsizliğini korumaktadır.Gp130/IL6 sitokin ailesine ait olan onkostatin M, temel olarak makrofajlar, monositler ve T hücreleri tarafından salınır ve hücre farklılaşması, proliferasyonu ve inflamatuar ağda pleiotropik aktiviteler uygular. Çeşitli hücre ve kanser türlerinde, OSM'nin paradoksal olarak inflamasyonu hem desteklediği hem de inhibe ettiği bildirildi. Sitokin IL-6'nın kas atrofisi ile ilişkili olduğu bilinmesine rağmen, sitokin OSM'nin iskelet kası hücrelerindeki fonksiyonel önemi yeterince bilinmemektedir.Yüksek verimli sıralama teknolojilerinin ortaya çıkışı, RNA yı incelemek için benzeri görülmemiş bir yaklaşım sundu.Bu nedenle, hücre transkriptlerini karakterize etmek ve ölçmek için birincil seçim haline geldi. Burada, yüksek verimli RNA dizileme (RNA-seq) teknolojisini kullanarak iskelet kası hücrelerinde sitokin Oncostatin M hedef genlerini tanımlayarak kas dokusuna tümör sinyalini araştırmayı amaçlıyoruz. " Özelleştirilmiş Boru Hattı" kullanarak IL6 ailesi sitokinlerini, özellikle OSM, IL6 ve LIF'yi analiz ettik.Fare birincil miyotüp hücrelerini bu sitokinlerle tedavi ettik ve önemli ölçüde yukarı ve aşağı regüle olan ve kas atrofisi ile ilişki gösteren farklı şekilde eksprese edilen genleri deşifre ettik. RNA dizilimi, sitokin ile muamele edilmiş numunelerde kontrol numunelerine kıyasla yaygın değişiklikler gösterdi, diğer koşullara kıyasla OSM ile muamele edilmiş numunelerde en büyük farklılıklar. OSM, Ampd3, Sln, Murf-1, Atrogin-1 ve Serpina3n gibi kas atrofisi ile ilgili genleri önemli ölçüde indükledi. Bununla tutarlı olarak, bu imza genleri qRT-PCR kullanılarak onaylandı.GSEA analizi en yaygın olarak zenginleştirilmiş yolların hipoksi, inflamatuar yanıt yolu, glikoliz ve IL6-JAK-STAT3 yollarını içerdiğini ortaya koydu. Bu sonuçlar, sitokine özgü yanıt modelleriyle fare birincil miyotüp hücrelerinde OSM, IL6 ve LIF ekspresyon yanıtlarının küresel bir görünümünü sağlar. Sonuçlarımız, bu sitokinlerin fare birincil miyotüp hücrelerinde benzer sinyal mekanizmalarını kullanabileceğini gösteriyor. IL6 ve LIF ile karşılaştırıldığında, OSM, 6 kültürlenmiş miyotüplerde hücresel atrofiyi güçlü bir şekilde teşvik eder. Sitokin kaynaklı mekanizmaların aydınlatılması kaşektik sendromun tedavisi için potansiyel terapötik hedefler oluşturabilir. Bulgularımız, hücresel kas atrofisinde OSM'nin önemli bir rolünü desteklemektedir ve OSM'nin kanser veya diğer kronik hastalıklarla ilişkili kaşeksi ile mücadelede yeni bir faktör olarak hedeflenebileceğini düşündürmektedir