Kanser tedavisi için yapıya dayalı ilaç dizaynı ve ilaçların sayısal yapı aktivite ilişkili analizleri

Yapıya dayalı ilaç dizaynında, hedeflenen hastalikla ilişkisi bilinen kimyasal reaksiyonlarin ozelliklerinden faydalanılır. Hastalıgın gelişiminde rol oynayan kimyasal reaksiyonların ve bu reaksiyonlarda görev alan önemli enzimlerin saptanması yapıya dayalı ilaç dizaynının ilk adımıdır. Daha sonra, hedef olarak belirlenen enzimin aktif bolgesi belirlenir ve bu bolgeye yapışarak enzim çalışmasını engelleyecek moleküller geliştirilir.Bu çalışmada, yeni ilaçlar geliştirilmesi hedeflenerek, yapıya dayalı ilaç dizaynı teknikleri iki farklı hedef proteine uygulandı. Cytochrome P450 C17, androjen sentezinde rol alan en önemli enzimlerden biridir ve bu enzimi hedefleyen bir ilaçla prostat kanserinin gelişimi engellenebilmektedir. Ikinci hedef protein olan XPF, DNA onarım sistemindeki en önemli proteinlerden biridir ve bu çalışmada XPF-ERCC1 protein komplexini hedef alarak DNA onarımını engelleyip kanserli hücrelerin kemoterapik ilaçlara karşı direnç kazanmasını önleyecek moleküller elde etmeyi amaçladık. Her iki çalışmada da umut vaad eden moleküller elde ettik.Çalışmanın son kısmında sunulan yeni bir Sayısal Yapı-Aktivite İlişkisi analizi metoduyla, dizayn edilen ilaçların labaratuar deneyleri yapılmaksızın aktivite seviyelerini öngörebilmeyi amaçladık. Bu çalışmada sunulan method literatürde bulunan diğer methodlardan daha iyi sonuçlar elde etmeyi başardı.