Comparing environmental dna metabarcoding and underwater visual census in assessing fish biodiversity in a marine protected area: Kaş-Kekova MPA

Antropolojik faaliyetlerin etkileri biyolojik çeşitlilik kaybına yol açan başlıca nedenlerden biridir. Deniz biyoçeşitliliği, özellikle de balıklar, en çok zararı, aşırı avlanma, kirlilik, habitat kaybı ve fragmantasyonu nedeniyle insan faaliyetlerinden görmektedir. Bu nedenle Deniz Koruma Alanları, deniz biyolojik çeşitliliğinin ve habitatının korunması ve muhafaza edilmesinde önemli bir rol oynamaktadır. Bununla birlikte, bu tür alanlardaki tür çeşitliliğinin biyoizlemesi genellikle maliyetli, invaziv olabilen, yüksek taksonomik uzmanlık gerektiren ve potansiyel olarak sübjektifliğe ve hataya açık olan geleneksel araştırmalara bağlıdır. Geleneksel araştırmalara alternatif olarak eDNA metabarkodlaması, biyolojik çeşitlilik noktalarındaki çeşitliliği değerlendirmek ve izlemek için kullanılabilir. Bu çalışmada, Antalya, Türkiye'de Kaş-Kekova deniz koruma alanından 16 istasyonda üç farklı örnekleme derinliğinden (yüzey, 12m ve 24m) 21 deniz suyu örneği toplandı. eDNA metabarkodlamasında COI ve 12S rRNA işaretleyicilerini hedef alan iki set evrensel primer kullanıldı. Bu çalışma, Kaş-Kekova DEKA'daki balık biyoçeşitliliğini eDNA metabarkodlama ile değerlendirmek ve bunu eş zamanlı sualtı görsel sayım (UVC) bulgularıyla karşılaştırmak ve eDNA metabarkodlamanın alanda kaydedilen balık biyoçeşitliliğini çapraz doğrulayıp doğrulamadığını ve geleneksel yöntemlerin tespit etmekte yetersiz kalabileceği istilacı veya yakalanması zor türlerin varlığını tespit etmeyi amaçlamıştır. Analiz sonuçları, iki yöntemin birbirini tamamladığını ve daha iyi örnekleme çalışmasıyla eDNA metabarkodlamanın kullanılmasının tür çeşitliliğinin değerlendirilmesi ve olası istilacı türlerin varlığının önceden habercisi olması açısından umut verici olabileceğini gösterdi.