Computational search of the interaction between melanopsin and cryptochrome proteins

Canlıların biyolojik, fizyolojik ve davranışsal fonksiyonlarındaki salınımlara Sirkadyanritmleri adı verilir. Sirkadyan ritmler yaklaşık olarak 24 saatlik döngülerle tekrarlanırlar.Memelilerde bu ritmler içsel bir saat tarafından düzenlenir; iç saat mekanizması beyindebulunan suprakiazmatik çekirdek (SCN) adlı yapı tarafından kontrol edilmektedir. SCN,çevresel ışık-karanlık evreleri ile senkronize çalışır.Retina tarafından algılanan ışık SCN'ye optik sinirler aracılığı ile haber verilmektedir.Retinada ışık algılayıcı proteinler bulunmaktadır. Bu proteinler retinadaki ışığı algılayıp içselsaate sinyal iletimi yapmak ile görevlidirler. Cryptochrome ve Melanopsin adlı proteinler(muhtemelen opsin familyasından başka proteinler ile birlikte) Sirkadyan ritmlerde görevalan, ışığı algılayan fotoreseptörlerdir.Deneysel sonuçlar iç saatin düzenli çalışması için Cryptochrome ve Melanopsinproteinlerinin muhtemel bir etkileşim içinde olmalari gerektiğini göstermektedir. Buçalışmada, olası etkileşimi kanıtlayabilmek için Melanopsin ve Cryptochrome proteinlerinintersiyer yapıları; ve iki protein arasındaki etkileşim hesaplamalı yöntemler kullanılarakbulunmuştur.Çalışmanın sonuçları memeli Melanopsin ve Cryptochrome proteinlerinin etkileşimiçerisinde olduğunu göstermektedir. Cryptochrome proteinin N-ucu Melanopsin proteinin C-ucu ve sitoplazmik kısımları ile etkileşmektedir. In vivo etkileşim, flüoresan mikroskopitekniği ile desteklenmektedir.