Analysis of erbin gene expression regulation by micrornasin breast cancer

Meme kanseri, farklı hastalık sonucu tahminleri ve tedavi yanıtlarıyla ilişkili olan farklı moleküler alt tipleri, belirli gen belirteçleri ve mutasyonlarla karakterize heterojen bir hastalıktır. ERBIN (ERBB2IP) geni, epitel hücre polaritesini ve adezyonunu koruyan, bazolateral konumlu bir iskelet/adaptör proteinini kodlar ve ayrıca MAPK ile TGF-β dahil olmak üzere birçok temel sinyal yolaklarını düzenler. ERBIN gen ifade seviyesi, HER2-pozitif meme kanseri dahil olmak üzere, hastalıklarda duruma bağlı olarak değişiklik göstermektedir. Ancak, anormal ERBIN ifade düzeylerine yol açan mekanizmalar yeterince araştırılmamıştır. Bu çalışma, farklı meme kanseri alt tiplerinde ERBIN geninin ifadesini düzenleyen belirli miRNA'ları belirlemeyi ve miRNA-ERBIN ekseni içindeki ek düzenleyici etkileşimleri araştırmayı amaçlamaktadır. Bu amaçla, kamuya açık meme kanseri hasta veri setlerindeki ERBIN gen ifadesi; moleküler alt tip, TP53 mutasyon durumu ve hormon reseptörü durumuna göre analiz edilmiştir. ERBIN ile miRNA ekspresyonu arasındaki korelasyon analizi, çeşitli miRNA hedef tahmin araçlarının sonuçlarıyla birleştirilerek ERBIN gen ifadesini potansiyel olarak düzenleyen miRNA adayları belirlenmiştir. Bu adayların, klinik özelliklere göre ERBIN ile ters ilişkilerini anlamak amacıyla, agresif alt gruplarda ifade durumları değerlendirilmiştir. Ayrıca, MDA-MB-231 hücrelerinde ERBIN gen ekspresyonunun baskılanması sonrasında yapılan miRNA-seq çalışması, ERBIN ile seçilmiş miRNA'lar arasındaki potansiyel düzenleyici geri besleme döngülerini ortaya koymuştur. Genel olarak, bu çalışmanın sonuçları agresif meme kanserinde ERBIN'in post-transkripsiyonel düzenlenmesine dair kapsamlı bir bakış sunmakta ve miRNA–ERBIN ilişkilerinin potansiyel biyobelirteç veya terapötik hedefler olabileceğini göstermektedir.