Evaluation of TAGLN as a diagnostic marker in breast cancer

Promotör bölgelerinde CpG hipermetilasyonu yoluyla tümör baskılayıcı genlerin susturulması, farklı kanser türlerinde sık karşılaşılan olaylardan biridir. Bu genler tanısal veya prognostik biyobelirteç olma potansiyeline sahiptir. Sıvı biyopsi, erken tanı, tedaviye yanıt tahmini, minimal kalıntı hastalık tespiti ve tümör ilerleyişinin gerçek zamanlı izlenmesi için kullanılan görece daha az invazif olan bir tekniktir. Bu çalışmada, TAGLN promotör metilasyon düzeylerinin meme kanserinde biyobelirteç potansiyelini değerlendirmek için, 402 bç'lik bir bölge (Bölüm 1 için -286 bç ile -80 bç, Bölüm 2 için -102 bç ile +115 bç) ve 22 CpG içeren TAGLN promotör bölgesi meme kanseri hastalarında ve sağlıklı bağışçılarda analiz edildi. TAGLN promotör bölgesi meme kanseri hastalarında (%77.3) sağlıklı bağışçılara (%68.2) kıyasla isttistiksel olarak anlamlı orande hipermetile olduğu tespit edilmiştir. Meme kanseri hastalarında bakılan 22 farklı CpG arasında, 6 tanesi hipermetile ve 1 tanesi hipometile olarak bulunmuştur. Ayrıca TAGLN promotör metilasyon düzeyleri ile hastanın klinikopatolojik parametreleri arasındaki ilişki analiz edilmiştir. Analizler, TAGLN promotör bölgesinin 50 yaş üzeri meme kanseri hastalarında, aynı yaş grubundaki sağlıklı bağışçılara göre yüksek oranda metillendiğini ortaya çıkarmıştır. TAGLN promotör metilasyonu, meme kanseri hastalarının çeşitli klinikopatolojik parametrelerinde farklılık göstermediği bulunmuştur. TAGLN promotör metilasyon seviyeleri, meme kanseri hastalarını %74.45 özgüllük ve %57.58 hassaslık değerleri ile tespit edebilmiştir. Ek olarak, yaş grubundan bağımsız olarak meme kanseri hastaları (131.6 ng) sağlıklı bağışçılara (56.4 ng) kıyasla daha yüksek toplam cfDNA seviyelerine sahipti. Toplam cfDNA seviyeleri, meme kanseri hastalarının çeşitli klinikopatolojik parametrelerinde farklılık göstermemiş, ancak toplam cfDNA seviyesinin %73.33 özgüllük ve %56.72 hassaslık ile meme kanseri hastalarını teşhis edebildiği gösterilmiştir. Özetle, tümör profilini tanımlamak için meme kanseri hasta serumu kaynak olarak kullanılabilir. TAGLN metilasyonu ve toplam cfDNA seviyesi, meme kanserinde tanısal amaçla belirteç olarak kullanılabilir.